| 講演名 | 2015-03-05 Boolean mapping of a multivalued model using GINsim : A toy example 三谷 和織, 松野 浩嗣, フォレ アドリエン, |
|---|---|
| PDFダウンロードページ |  PDFダウンロードページへ |
| 抄録(和) | GINsimは理論的手法を用いた遺伝子制御回路の解析ツールであり、特定の遺伝子によって作られる回路の働きとその状態推移を生成する機能を持つ。この回路には、システムの挙動に影響を与える機能的な部分と影響を与えない非機能的な部分があるが、回路内に別の経路が存在する場合、本来機能的であるはずの部分回路が非機能的として扱われてしまう場合がある。この性質を調べるために、サイクルをもつ状態推移を生成する簡単な遺伝子制御回路を用いたが、挙動の理解を容易にするために、遺伝子制御回路にBoolean mappingを行うと状態推移に非許容状態が出現してしまう。本稿の目的は、このような問題を論理式の設計にのみ依存した方法で解決することである。 |
| 抄録(英) | The software GINsim introduced the notion of circuit functionality to analyze the behavior of regulatory circuits in different regions of the state space. Interpretation of the circuit functionality results is particularly difficult in the multivalued case and when circuits contain shortcuts. Boolean mapping could be a way to disentangle interwined regulatory circuits in order to facilitate the understanding of their behaviour. However, its implementation in GINsim will require a solution to the problem of non-admissible configurations. Although it is possible to artificially remove these nodes, our aim is to solve the problem relying only on logical expression design. |
| キーワード(和) | 回路機能 / GINsim / Boolean mapping |
| キーワード(英) | circuit functionality / GINsim / Boolean mapping |
| 資料番号 | MSS2014-96 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS |
|---|---|
| 開催期間 | 2015/2/26(から1日開催) |
| 開催地（和） | |
| 開催地（英） | |
| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
| 委員長氏名（英） | |
| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Mathematical Systems Science and its applications(MSS) |
|---|---|
| 本文の言語 | ENG |
| タイトル（和） | |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Boolean mapping of a multivalued model using GINsim : A toy example |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 回路機能 / circuit functionality |
| キーワード(2)（和/英） | GINsim / GINsim |
| キーワード(3)（和/英） | Boolean mapping / Boolean mapping |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 三谷 和織 / Kaori MITANI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 松野 浩嗣 / Hiroshi MATSUNO |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | フォレ アドリエン / Adrien FAURE |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 発表年月日 | 2015-03-05 |
| 資料番号 | MSS2014-96 |
| 巻番号（vol） | vol.114 |
| 号番号（no） | 493 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 4 |
| 発行日 | |