| 講演名 | 2014/6/18 パスウェイ情報を用いた顧みられない熱帯病創薬支援のための統合データベースiNTRODBの改良(機械学習によるバイオデータマインニング,一般) 蓮実 梢, 石田 貴士, 秋山 泰, |
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| 抄録(和) | 標的となるタンパク質を定めて行う薬剤開発において,薬剤標的タンパク質の選定はとても重要となる.この標的タンパク質探索には,既に病原体のゲノム情報等を利用して探索を行うための統合的なデータベースシステムが提案されてきたが,その生化学経路情報については統合の対象とされていなかった.しかし,この情報を用いることであるタンパク質が病原体の生命維持に対して致命的であるかという議論が可能となるため,生化学経路情報の統合は標的タンパク質の探索のために有用であると考えられる.そこで本研究では,顧みられない熱帯病の新薬の標的タンパク質を探索するための統合データベースシステムiNTRODBに,トリパノソーマ科寄生原虫に関する生化学経路情報を追加し,またそこにゲノム等に関連する情報を表示するインタフェースを開発することで,標的タンパク質の探索の更なる効率化を目指した. |
| 抄録(英) | In structure based-drug design, selecting a drug target protein is very important. For the target protein selection, several database systems integrating various related information, such as genomic information of pathogens and phenotypic information, have been proposed. However, biological pathway information, which may facilitate understanding the importance of proteins, has not been integrated. In this research, we integrated the biological pathway information about Trypanosomatidae family, protozoans parasites into a database system iNTRODB, which has been developed for selecting drug target protein of neglected tropical diseases. We also developed an interface to display pathway information with genome and protein information to improve the search process of drug target proteins. |
| キーワード(和) | 顧みられない熱帯病 / iNTRODB / KEGG / トリパノソーマ |
| キーワード(英) | Neglected Tropical Diseases / iNTRODB / KEGG / Trypanosomatidae |
| 資料番号 | Vol.2014-MPS-98 No.34,Vol.2014-BIO-38 No.34 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | IBISML |
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| 開催期間 | 2014/6/18(から1日開催) |
| 開催地（和） | |
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| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Information-Based Induction Sciences and Machine Learning (IBISML) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | パスウェイ情報を用いた顧みられない熱帯病創薬支援のための統合データベースiNTRODBの改良(機械学習によるバイオデータマインニング,一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Improvement of a database for supporting NTDs drug discovery based on biological pathway information |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 顧みられない熱帯病 / Neglected Tropical Diseases |
| キーワード(2)（和/英） | iNTRODB / iNTRODB |
| キーワード(3)（和/英） | KEGG / KEGG |
| キーワード(4)（和/英） | トリパノソーマ / Trypanosomatidae |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 蓮実 梢 |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 東京工業大学工学部情報工学科 Dept. of computer science, Tokyo Institute of technology |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 石田 貴士 |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻 Graduate School of Information Science and Engineering, Tokyo Institute of technology |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 秋山 泰 |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻:東京工業大学情報生命博士教育院 Graduate School of Information Science and Engineering, Tokyo Institute of technology:Education Academy of Computational Life Science, Tokyo Institute of technology |
| 発表年月日 | 2014/6/18 |
| 資料番号 | Vol.2014-MPS-98 No.34,Vol.2014-BIO-38 No.34 |
| 巻番号（vol） | vol.114 |
| 号番号（no） | 105 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 7 |
| 発行日 | |