| 講演名 | 2014-01-21 自己組織化マップを用いたDNA配列の視覚化と判別(ニューロコンピューティングの実装及び人間科学のための解析・モデル化,一般) 金子 勇太郎, 堂園 浩, |
|---|---|
| PDFダウンロードページ |  PDFダウンロードページへ |
| 抄録(和) | DNAは生物の形態や特徴を決める遺伝情報を含んだゲノムを形成している.DNA塩基配列の大域的な類似性等を解析することによって,生物の多様性や進化系統を探索することが可能である.最近では次世代シーケンサー技術によって日々膨大な配列データが作りだされ,その大量のデータを解析する効率的な方法が必要ともなっている.そこで,本論文では多次元データの関係性を可視化することができるSOM(自己組織化マップ)を用いて,DNA配列における塩基の出現頻度を入力データとしたマップを作成し解析する手法を使用して,その性能を確認し,評価する方法を検討する. |
| 抄録(英) | Recently, the next generation sequencers produce the large amount of sequence information of DNA. Thus, it becomes problem to extract the relevant information from whole information. In this study, it is intended to efficiently extract a variety of information hidden in DNA sequence using Self Organizing Maps, which can visualize the multi-dimensional data on the two dimensional plane. The experiments of classification for the DNA sequence of some species and some metabolic functions are conducted, and propose the method examine its performance. |
| キーワード(和) | 自己組織化マップ(SOM) / DNA配列解析 |
| キーワード(英) | Self Organizing Map(SOM) / next generation sequencing |
| 資料番号 | NC2013-79 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
|---|---|
| 開催期間 | 2014/1/13(から1日開催) |
| 開催地（和） | |
| 開催地（英） | |
| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
| 委員長氏名（英） | |
| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
|---|---|
| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 自己組織化マップを用いたDNA配列の視覚化と判別(ニューロコンピューティングの実装及び人間科学のための解析・モデル化,一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Visualization and Discrimination of DNA sequences using Self-Organizing Maps |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 自己組織化マップ(SOM) / Self Organizing Map(SOM) |
| キーワード(2)（和/英） | DNA配列解析 / next generation sequencing |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 金子 勇太郎 / Yutaro Kaneko |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 佐賀大学大学院工学系研究科先端融合工学専攻 Graduate School of Science and Engineering, Saga University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 堂園 浩 / Hirosi Dozono |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 佐賀大学大学院工学系研究科先端融合工学専攻 Graduate School of Science and Engineering, Saga University |
| 発表年月日 | 2014-01-21 |
| 資料番号 | NC2013-79 |
| 巻番号（vol） | vol.113 |
| 号番号（no） | 382 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 5 |
| 発行日 | |