| 講演名 | 2013/6/20 情報科学的手法によるnon-coding RNAの遺伝子発現制御の解析(機械学習によるバイオデータマインニング,一般) 林 知里, 權 娟大, 宮崎 智, |
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| 抄録(和) | ゲノム解析が進んだ結果,ゲノムDNA中にはタンパク質の遺伝子以外の分子情報をコードしている領域や発現の制御に関わる領域が存在することが明らかになった.これらの領域の中で,主な機能として発現制御等に関わるRNA分子の遺伝子をコードしている領域があり,この領域から転写されたRNAはnon-coding RNA (ncRNA)と呼ばれている.ncRNAは他の遺伝子の転写制御に関わりを持つと考えられているが,未だその機能が解明されていないものも多い.一方で,ある疾患に特異的に発現するncRNAが発見されており,ncRNAが創薬ターゲットになる可能性を持っている.また,現在発見されているncRNAの多くはタンパク質遺伝子間に存在するが,あるタンパク質遺伝子のイントロンにncRNAが存在することが分かっている.本研究では,タンパク質遺伝子とncRNAのゲノム上の位置関係に着目し,疾患関連遺伝子を制御する創薬ターゲットとしてのncRNAを予測することを目的とする.本稿では,イントロンに存在するncRNAに着目した生物種間での比較結果を報告する. |
| 抄録(英) | Advances in genome analysis have revealed that a genomic DNA contains gene coding regions other than protein coding sequences and transcription-regulating regions. Among these regions, there exist RNA coding regions involved in transcription regulation as a primary function, RNAs transcribed from these regions are referred to as non-coding RNAs (ncRNAs). ncRNAs are known to affect regulation of transcription, but many functions are still unknown. On the other hand, since some ncRNAs specifically express in a particular disease, they may have potential for being used as drug targets. Also, while most of ncRNAs currently observed locate on intergenic regions of protein coding genes, some ncRNAs locate on intronic regions of protein coding genes. The aim of this work is to predict ncRNAs as drug targets regulating disease-associated genes based on positional relationship between protein genes and ncRNAs on a genome. In this paper, we compare ncRNAs located on intronic regions across species. |
| キーワード(和) | non-coding RNA / 遺伝子発現 / イントロン / データベース |
| キーワード(英) | non-coding RNA / gene expression / intron / database |
| 資料番号 | Vol.2013-BIO-34 No.2 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2013/6/20(から1日開催) |
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| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 情報科学的手法によるnon-coding RNAの遺伝子発現制御の解析(機械学習によるバイオデータマインニング,一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Non-coding RNA analysis for gene expression regulation using bioinformatics tools |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | non-coding RNA / non-coding RNA |
| キーワード(2)（和/英） | 遺伝子発現 / gene expression |
| キーワード(3)（和/英） | イントロン / intron |
| キーワード(4)（和/英） | データベース / database |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 林 知里 / CHISATO HAYASHI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 東京理科大学大学院薬学研究科薬科学専攻 Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Tokyo University of Science |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 權 娟大 / YEONDAE KWON |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 東京理科大学薬学部生命創薬科学科 Department of Medical and Life Science, Faculty of Pharmaceutical Sciences, Tokyo University of Science |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 宮崎 智 / SATORU MIYAZAKI |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 東京理科大学薬学部生命創薬科学科 Department of Medical and Life Science, Faculty of Pharmaceutical Sciences, Tokyo University of Science |
| 発表年月日 | 2013/6/20 |
| 資料番号 | Vol.2013-BIO-34 No.2 |
| 巻番号（vol） | vol.113 |
| 号番号（no） | 111 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |