| 講演名 | 2012-07-03 セルアレイデータに基づくがん細胞分類を支援するタンパク質情報可視化手法の提案(システムと信号処理及び一般) 北風 裕教, 井川 翔平, 伊藤 剛, 古屋 智子, 神田 全啓, 池田 信彦, 松野 浩嗣, |
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| 抄録(和) | レーザースキャニングサイトメータを用いたセルアレイ技術は,細胞内の網羅的なタンパク質分布状況を数値化することで,がん細胞で有意な発現変動を示すタンパク質セットの推定を可能にする.しかし豊富な知識と経験がある病理医師にとっても,これらの数値情報から分類診断を行うことは容易ではない.そこで我々はタンパク質情報を,グラフィック技術を用いることにより分かりやすく可視化することで,この分類診断を支援することを考えた.具体的には,分類基準となるタンパク質の発現範囲や発現量,凝集度の分布の3情報を可視化数列によって表現し,さらにその直感的イメージを提示できるシステムを作成した.この可視化数列には,セルアレイ情報の本質的部分を失うことなく情報圧縮ができるという利点があり,多量なデータの解析の効率化に貢献できる. |
| 抄録(英) | Cell array technology using a laser scanning cytometer is to quantify the distribution of intracellular protein, which can allow an estimation of the protein, set to indicate a significant change in expression of cancer cells. However, even for a doctor of pathology to perform such classification of information from these numbers is not easy. So, we can visualize by using easy-to-understand graphics technology, information of protein, thought to support this classification. More specifically, we create a system to visualize these information which are represented by a sequence of three kinds of information cohesion distribution range, the protein expression level and classification criteria. This visualization sequence has the advantage of compression of the data without losing the essential part of the cell array information and also contribute to the efficiency of a large amount of data analysis. |
| キーワード(和) | がん細胞 / タンパク質 / 可視化 / レーザースキャニングサイトメーター / 分類 / セルアレイ |
| キーワード(英) | cancer cell / protein / visualization / laser scanning cytometer / classification / cell array |
| 資料番号 | CAS2012-23,VLD2012-33,SIP2012-55,MSS2012-23 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS |
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| 開催期間 | 2012/6/25(から1日開催) |
| 開催地（和） | |
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| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Mathematical Systems Science and its applications(MSS) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | セルアレイデータに基づくがん細胞分類を支援するタンパク質情報可視化手法の提案(システムと信号処理及び一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A Visualization Method for Cancer Classification based on Protein Distribution Data from the Cell Array |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | がん細胞 / cancer cell |
| キーワード(2)（和/英） | タンパク質 / protein |
| キーワード(3)（和/英） | 可視化 / visualization |
| キーワード(4)（和/英） | レーザースキャニングサイトメーター / laser scanning cytometer |
| キーワード(5)（和/英） | 分類 / classification |
| キーワード(6)（和/英） | セルアレイ / cell array |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 北風 裕教 / Hironori KITAKAZE |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 大島商船高等専門学校 Oshima College of Maritime Technology |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 井川 翔平 / Shouhei IGAWA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 大島商船高等専門学校 Oshima College of Maritime Technology |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 伊藤 剛 / Tsuyoshi ITO |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 大島商船高等専門学校 Oshima College of Maritime Technology |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 古屋 智子 / Tomoko FURUYA |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院医学系研究科 Graduate School of Medicine, Yamaguchi University |
| 第 5 著者 氏名（和/英） | 神田 全啓 / Masahiro KANDA |
| 第 5 著者 所属（和/英） | 大島商船高等専門学校 Oshima College of Maritime Technology |
| 第 6 著者 氏名（和/英） | 池田 信彦 / Nobuhiko IKEDA |
| 第 6 著者 所属（和/英） | 徳山工業高等専門学校情報電子工学科 Tokuyama College of Technology, Dept.of Computer Science & Electronic Engineering |
| 第 7 著者 氏名（和/英） | 松野 浩嗣 / Hiroshi MATSUNO |
| 第 7 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 発表年月日 | 2012-07-03 |
| 資料番号 | CAS2012-23,VLD2012-33,SIP2012-55,MSS2012-23 |
| 巻番号（vol） | vol.112 |
| 号番号（no） | 116 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |