講演名 2012-06-21
無順序木の編集距離の指数時間厳密アルゴリズム
阿久津 達也, 田村 武幸, 深川 大路, 高須 淳宏,
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抄録(和) 本稿ではNP困難問題として知られる無順序木の編集距離の効率的な指数時間アルゴリズムを扱う。n_1とn_2を2つの入力の木のノード数とすると、一般の場合に対するO(1.26^)時間アルゴリズムを示す。このアルゴリズムは動的計画法、全探索、最大重み付き二部マッチングを組み合わせて得られる。また、次数が制限されアルファベットが固定の時には、任意の定数ε>0に対し、O((1+ε)^)時間でこの問題が解けることを示す。この結果は、小さい部分木内の同じ部分集合に対する再計算を避けることにより得られたものである。
抄録(英) This report presents efficient exponential time algorithms for the unordered tree edit distance problem, which is known to be NP-hard. For a general case, an O(1.26^) time algorithm is presented, where n_1 and n_2 are the numbers of nodes in two input trees. This algorithm is obtained by a combination of dynamic programming, exhaustive search, and maximum weighted bipartite matching. For bounded degree trees over a fixed alphabet, it is shown that the problem can be solved in O((1+ε)^) time for any fixed ε > 0. This result is achieved by avoiding duplicate calculations for identical subsets of small subtrees.
キーワード(和) 木の編集距離 / 無順序木 / 動的計画法 / 最大重み付き二部マッチング
キーワード(英) tree edit distance / unordered trees / dynamic programming / maximum weight bipartite matching
資料番号 COMP2012-15
発行日

研究会情報
研究会 COMP
開催期間 2012/6/14(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Theoretical Foundations of Computing (COMP)
本文の言語 ENG
タイトル(和) 無順序木の編集距離の指数時間厳密アルゴリズム
サブタイトル(和)
タイトル(英) Efficient Exponential Time Algorithms for Edit Distance between Unordered Trees
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) 木の編集距離 / tree edit distance
キーワード(2)(和/英) 無順序木 / unordered trees
キーワード(3)(和/英) 動的計画法 / dynamic programming
キーワード(4)(和/英) 最大重み付き二部マッチング / maximum weight bipartite matching
第 1 著者 氏名(和/英) 阿久津 達也 / Tatsuya AKUTSU
第 1 著者 所属(和/英) 京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター
Bioinformatics Center, Institute for Chemical Research, Kyoto University
第 2 著者 氏名(和/英) 田村 武幸 / Takeyuki TAMURA
第 2 著者 所属(和/英) 京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター
Bioinformatics Center, Institute for Chemical Research, Kyoto University
第 3 著者 氏名(和/英) 深川 大路 / Daiji FUKAGAWA
第 3 著者 所属(和/英) 同志社大学文化情報学部
Faculty of Culture and Information Science, Doshisha University
第 4 著者 氏名(和/英) 高須 淳宏 / Atsuhiro TAKASU
第 4 著者 所属(和/英) 国立情報学研究所
National Institute of Informatics
発表年月日 2012-06-21
資料番号 COMP2012-15
巻番号(vol) vol.112
号番号(no) 93
ページ範囲 pp.-
ページ数 7
発行日