| 講演名 | 2011/11/10 サイクリック構造を含むシグナル伝達経路ペトリネットモデルの滞留なし発火頻度決定手法の提案(グラフ,ペトリネット,ニューラルネット,及び一般) 村上 祐樹, 葛 崎偉, 松野 浩嗣, |
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| 抄録(和) | 本稿では,サイクリック構造を含むシグナル伝達経路ペトリネットモデルが滞留なしペトリネットとなるために満たさなければならない条件について検討する.滞留なしペトリネットとは,いずれのプレースにおいても流れてくるトークンと流れ出ていくトークンの量が等しいペトリネットである.シグナル伝達経路におけるシグナルの伝達が,主に酵素によるタンパク質のリン酸化によって行われることから,シグナル伝達経路の中で酵素の果たす役割は大きい.この酵素はタンパク質をリン酸化する働きに対しては触媒として作用するため,ペトリネットにおいては自己ループによって表現される.サイクリック構造とは,この自己ループを最小構造とする構造的循環,つまり反応のループであり,これらの構造を含むペトリネットが滞留なしペトリネットとなるために満たさなければならない条件を導く. |
| 抄録(英) | In this paper, we discuss the condition that must be satisfied for cycle-contained Petri net model of signaling pathway to be retention-free Petri net. Retention-free Petri net is a timed Petri net such that total input token-flow and total output token-flow are equivalent at any place. Transmission of the sinal in signaling pathway is mainly worked by phosphorylation of the protein by enzyme that plays a great role in signaling pathway. In Petri net, an enzyme is expressed by a self-loop in order to act as a catalyst to the work which phosphorylates protein. Cyclic structure is loop structure and self-loop is the minimum one. For Petri net model including cyclic structure, we conduct the conditions of retention-free Petri net. |
| キーワード(和) | シグナル伝達経路 / 時間ペトリネット / 滞留なしペトリネット / サイクリック構造 / 自己ループ |
| キーワード(英) | signaling pathways / timed Petri net / retention-free Petri net / cyclic structure / self loop |
| 資料番号 | MSS2011-45,CAS2011-76 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS |
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| 開催期間 | 2011/11/10(から1日開催) |
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| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Mathematical Systems Science and its applications(MSS) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | サイクリック構造を含むシグナル伝達経路ペトリネットモデルの滞留なし発火頻度決定手法の提案(グラフ,ペトリネット,ニューラルネット,及び一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Proposal of a method to determine retention-free firing frequencies in cycle-contained Petri net model of signaling pathway |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | シグナル伝達経路 / signaling pathways |
| キーワード(2)（和/英） | 時間ペトリネット / timed Petri net |
| キーワード(3)（和/英） | 滞留なしペトリネット / retention-free Petri net |
| キーワード(4)（和/英） | サイクリック構造 / cyclic structure |
| キーワード(5)（和/英） | 自己ループ / self loop |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 村上 祐樹 / Yuki MURAKAMI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 葛 崎偉 / Qi-Wei GE |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 山口大学教育学部 Faculty of Education, Yamaguchi University |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 松野 浩嗣 / Hiroshi MATSUNO |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 発表年月日 | 2011/11/10 |
| 資料番号 | MSS2011-45,CAS2011-76 |
| 巻番号（vol） | vol.111 |
| 号番号（no） | 294 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |