| 講演名 | 2011/6/16 タンパク質の立体構造情報と類似部分グラフマイニングを利用した結合部位の自動抽出に関する研究(一般講演(バイオ情報学),機械学習によるバイオデータマインニング,一般) 文字 宏之, 大川 剛直, |
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| 抄録(和) | 多くのタンパク質は他のタンパク質と結合することでその機能を発現する。本研究では、タンパク質の立体構造データをもとに、計算機により結合部位を自動抽出することを目的としている。類似する機能を発現するタンパク質同士の結合部位は似ているという点と結合はタンパク質の分子表面上で起こるという2点に着目し、タンパク質の分子表面データを用いて、類似機能を発現するタンパク質から共通かつ特有な特徴をグラフマイニングを利用して発見することで結合部位の抽出を試みる。 |
| 抄録(英) | Most functions of proteins are expressed by the interactions with other molecular compounds(ligands) or the proteins. We propose a method to extract binding sites from 3D proteins structure data.Two concepts, proteins having a similar function tend to have a common binding site and an interaction occurs on the protein surface, are considered, and the binding sites are extracted by detecting the common and disctiminative features among the proteins of the similar functions by means of graph mining approach. |
| キーワード(和) | |
| キーワード(英) | |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.35 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2011/6/16(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
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| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | タンパク質の立体構造情報と類似部分グラフマイニングを利用した結合部位の自動抽出に関する研究(一般講演(バイオ情報学),機械学習によるバイオデータマインニング,一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A method of extracting binding sites from protein structures using similar subgraph mining |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 文字 宏之 / HIROYUKI MONJI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 神戸大学大学院システム情報学研究科 Graduate School of System Informatics, Kobe University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 大川 剛直 / TAKENAO OHKAWA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 神戸大学大学院システム情報学研究科 Graduate School of System Informatics, Kobe University |
| 発表年月日 | 2011/6/16 |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.35 |
| 巻番号（vol） | vol.111 |
| 号番号（no） | 96 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 4 |
| 発行日 | |