| 講演名 | 2011/6/16 水の情報エントロピーに注目したタンパク質のリガンド結合部位予測法の開発(一般講演(バイオ情報学),機械学習によるバイオデータマインニング,一般) 佐々木 孝章, 関嶋 政和, |
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| 抄録(和) | タンパク質とリガンドの結合は,タンパク質の機能発現や創薬に重要である.タンパク3000プロジェクトを始めとするタンパク質の大規模な構造解析により,多くのタンパク質の構造情報が得られてきており,タンパク質とリガンドとの結合を予測し,機能発現や創薬への応用が期待されている.従来,リガンド結合部位は立体構造解析と静電場の解析から求められてきており,その結果,in silicoによる創薬では相補的構造を有する分子を中心に探索されている.本研究では,水分子が自由度を得るとエントロピー的に有利に機能することを利用し,タンパク質周囲の水分子の情報エントロピーに注目し,リガンドの結合部位予測を行うシステムを開発した. |
| 抄録(英) | Protein and ligand docking is important for expression of protein function and drug development. Protein 3000 project and other structural analysis project determined much protein structures. And this huge structural information is expected to contribute analysis of expression of protein function and drug development. Previously, ligand binding pocket analysis was based on shape complementarity and electrostatic interaction. We developed and evaluated protein ligand binding site prediction system focused on information entropy of water around protein. |
| キーワード(和) | |
| キーワード(英) | |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.29 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2011/6/16(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
| 委員長氏名（英） | |
| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 水の情報エントロピーに注目したタンパク質のリガンド結合部位予測法の開発(一般講演(バイオ情報学),機械学習によるバイオデータマインニング,一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Development of protein ligand binding site prediction focused on water information entropy |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 佐々木 孝章 / TAKAAKI SASAKI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 東京工業大学計算工学専攻 Department of Computer Science, Tokyo Institute of Technology |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 関嶋 政和 / MASAKAZU SEKIJIMA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 東京工業大学計算工学専攻:東京工業大学学術国際情報センター Department of Computer Science, Tokyo Institute of Technology:Global Scientific Information and Computing Center, Tokyo Institute of Technology |
| 発表年月日 | 2011/6/16 |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.29 |
| 巻番号（vol） | vol.111 |
| 号番号（no） | 96 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 5 |
| 発行日 | |