| 講演名 | 2011/6/16 生物情報解析ワークフローのためのRESTサービスのSOAPサービス変換手法(合同企画セッション:バイオデータマイニング,機械学習によるバイオデータマインニング,一般) 池田 成吾, 木戸 善之, 瀬尾 茂人, 竹中 要一, 松田 秀雄, |
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| 抄録(和) | 多数のツールやサービスを組合せる必要がある生物情報解析を円滑に実行するためにワークフローが利用されている.しかしRESTサービスは仕様を記述するための標準的な形式が確立されていないため,ワークフローツールでの利用が困難である.そこで本研究では,生物情報解析を行うワークフローツールでRESTサービスを利用するための,SOAPサービスへの変換手法の提案を行う.提案手法では,RESTサービスのドキュメントをURL記載形式により分類し,各分類ごとに機械学習でRESTサービスのURLを抽出する.抽出したURLをもとにRESTサービスを中継するSOAPサービスを自動生成する.提案手法をBio Catalogueに登録されているRESTサービスに適用し,その有効性の検証を行った. |
| 抄録(英) | In bioinformatics, workflows have used frequently to combine many tools or services. But it have been difficult to use REST services by workflow tools, because there is no way to read their specification computationally. In this research, we proposed a method for using REST services inworkflows by converting REST services to SOAP services. This method classfies documents of REST services by their forms writing URL. And by using machine learning, this method extracts URLs of only REST services from classified documents. By using extracted URLs, this method generates SOAP services that access REST services. To show effectiveness of this method, we use it with example REST services registered in BioCatalogue. |
| キーワード(和) | |
| キーワード(英) | |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.9 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2011/6/16(から1日開催) |
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| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 生物情報解析ワークフローのためのRESTサービスのSOAPサービス変換手法(合同企画セッション:バイオデータマイニング,機械学習によるバイオデータマインニング,一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A method for using REST service in bioinformatics workflow by converting to SOAP service |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 池田 成吾 / SEIGO IKEDA |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院情報科学研究科 |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 木戸 善之 / YOSHIYUKI KIDO |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 大阪大学臨床医工学融合研究教育センター |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 瀬尾 茂人 / SHIGETO SENO |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院情報科学研究科 |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 竹中 要一 / YOICHI TAKENAKA |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院情報科学研究科 |
| 第 5 著者 氏名（和/英） | 松田 秀雄 / HIDEO MATSUDA |
| 第 5 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院情報科学研究科 |
| 発表年月日 | 2011/6/16 |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.9 |
| 巻番号（vol） | vol.111 |
| 号番号（no） | 96 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 7 |
| 発行日 | |