| 講演名 | 2011/6/16 ダイナミック・ガウス過程遺伝子発現ネットワーク予測 : MCMC実装(合同企画セッション:バイオデータマイニング,機械学習によるバイオデータマインニング,一般) 菊地 貴彰, 鈴木 知彦, 中田 洋平, 鏑木 崇史, 松本 隆, 君和田 友美, 和田 圭司, |
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| 抄録(和) | 本研究では,ダイナミック・ガウス過程によるノンパラメトリック・ベイズ的枠組みにより遺伝子発現データから遺伝子発現ネットワーク構造を推定することを目的とする,提案手法は,ガウス過程により遺伝子発現生成メカニズムに内在しているといわれる非線形性を捉える一方,ノンパラメトリックな枠組みにより,柔軟なモデルを構築しようとするものである.提案手法をマルコフ連鎖モンテカルロ法により実装し,本研究グループが採取した時計遺伝子の発現データに適用する. |
| 抄録(英) | A dynamic Gaussian process-based algorithm is proposed for predicting a gene regulatory network structure of mouse clock genes, which regulate circadian rhythm. The proposed algorithm attempts to capture nonlinear dynamics associated with gene expression values with Bayesian non-parametrics. Implementation was performed by a Markov Chain Monte Carlo (MCMC). |
| キーワード(和) | |
| キーワード(英) | |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.6 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2011/6/16(から1日開催) |
| 開催地（和） | |
| 開催地（英） | |
| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
| 委員長氏名（英） | |
| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | ダイナミック・ガウス過程遺伝子発現ネットワーク予測 : MCMC実装(合同企画セッション:バイオデータマイニング,機械学習によるバイオデータマインニング,一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Gene Regulatory Network Prediction using a Dynamic Gaussian Process : MCMC approach |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 菊地 貴彰 / TAKAAKI KIKUCHI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 早稲田大学大学院先進理工学研究科 Waseda University, Graduate School of Advanced Science and Engineering |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 鈴木 知彦 / TOMOHIKO SUZUKI |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 早稲田大学大学院先進理工学研究科 Waseda University, Graduate School of Advanced Science and Engineering |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 中田 洋平 / YOHEI NAKADA |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 青山学院大学経営システム工学科 Aoyama Gakuin University, Department of Industrial and Systems Engineering |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 鏑木 崇史 / TAKASHI KABURAGI |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 学習院大学計算機センター Gakushuin University, Computer Center |
| 第 5 著者 氏名（和/英） | 松本 隆 / TAKASHI MATSUMOTO |
| 第 5 著者 所属（和/英） | 早稲田大学理工学術院 Waseda University, Faculty of Science and Engineering |
| 第 6 著者 氏名（和/英） | 君和田 友美 / TOMOMI KIMIWADA |
| 第 6 著者 所属（和/英） | 宮城県立こども病院脳神経外科 Miyagi Children's Hospital, Neurosurgery |
| 第 7 著者 氏名（和/英） | 和田 圭司 / KEIJI WADA |
| 第 7 著者 所属（和/英） | 国立精神・神経医療研究センター神経研究所 National Center of Neurology and Psychiatry |
| 発表年月日 | 2011/6/16 |
| 資料番号 | Vol.2011-BIO-25 No.6 |
| 巻番号（vol） | vol.111 |
| 号番号（no） | 96 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 8 |
| 発行日 | |