講演名 2009-03-11
脳の大規模数理モデル構築共有プラットフォーム
観音 隆幸, 槇村 浩司, / 佐藤 俊治, 臼井 支朗,
PDFダウンロードページ PDFダウンロードページへ
抄録(和) これまで,脳の数理モデルは細胞レベルや領野あるいは個々の現象に着目したものが多く,脳全体をシステムとして理解するためには,それぞれの数理モデルを結合し,システムとしての大規模なシミュレーション研究を行う必要がある.そこで我々は,統合開発環境であるEclipseのプラグインとして,複数の数理モデルとそれに関連する実験データ・論文PDFなどを効率よく管理するためのデータベースConciergeプラグインと,統一されたデータフォーマットによる数理モデル開発を可能にするnetCDF-NIプラグインなどの共同開発プラットフォーム構築を開始したのでその概要を報告する.
抄録(英) Mathematical model of the brain developed so far have targeted specific brain areas such as, cells, networks and/or phenomena, including microscopic and macroscopic levels. However, in order to understand the whole brain system, integration of such specific models and large scale simulation studies are necessary. To tackle this issue, we are developing a collaborative platform implemented as an Eclipse plug-in. It consists of: the Concierge plug-in used to store, search and manage experimental data, paper PDFs, etc, which have being extended for the management of mathematical models as well; the netCDF-NI plug-in which allows users to easily implement input and output features to their models to make use of a common data format called netCDF.
キーワード(和) 数理モデル / 共同開発プラットフォーム / 共通データフォーマット / 研究資産管理 / メタデータ
キーワード(英) Mathematical model / platform for collaborative modeling / Common data format / Research resources / Metadata
資料番号 NC2008-109
発行日

研究会情報
研究会 NC
開催期間 2009/3/4(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Neurocomputing (NC)
本文の言語 JPN
タイトル(和) 脳の大規模数理モデル構築共有プラットフォーム
サブタイトル(和)
タイトル(英) Platform for a collaborative brain system modeling
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) 数理モデル / Mathematical model
キーワード(2)(和/英) 共同開発プラットフォーム / platform for collaborative modeling
キーワード(3)(和/英) 共通データフォーマット / Common data format
キーワード(4)(和/英) 研究資産管理 / Research resources
キーワード(5)(和/英) メタデータ / Metadata
第 1 著者 氏名(和/英) 観音 隆幸 / Takayuki KANNON
第 1 著者 所属(和/英) 理化学研究所脳科学総合研究センターニューロインフォマティクス技術開発チーム
Laboratory for Neuroinformatics, RIKEN Brain Science Institute
第 2 著者 氏名(和/英) 槇村 浩司 / Koji MAKIMURA
第 2 著者 所属(和/英) 理化学研究所脳科学総合研究センターニューロインフォマティクス技術開発チーム
Laboratory for Neuroinformatics, RIKEN Brain Science Institute
第 3 著者 氏名(和/英) / 佐藤 俊治 / Nilton Liuji KAMIJI
第 3 著者 所属(和/英) 理化学研究所脳科学総合研究センターニューロインフォマティクス技術開発チーム
Laboratory for Neuroinformatics, RIKEN Brain Science Institute
第 4 著者 氏名(和/英) 臼井 支朗 / Shunji SATOH
第 4 著者 所属(和/英) 理化学研究所脳科学総合研究センターニューロインフォマティクス技術開発チーム
Laboratory for Neuroinformatics, RIKEN Brain Science Institute
発表年月日 2009-03-11
資料番号 NC2008-109
巻番号(vol) vol.108
号番号(no) 480
ページ範囲 pp.-
ページ数 6
発行日