| 講演名 | 2008-05-23 FPGAを用いた生化学シミュレータにおける入力ポート制約を考慮した演算パイプラインスケジューリング(応用3) 石森 智也, 山田 英樹, 柴田 裕一郎, 長名 保範, 吉見 真聡, 西川 由理, 小嶋 利紀, 天野 英晴, 舟橋 啓, 広井 賀子, 小栗 清, |
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| 抄録(和) | FPGAベースの生化学シミュレータでは,デバイスの資源制約を考慮した高スループットな回路設計が重要である.本稿では,データの入力ポートの制約とハードウェアコストの削減を考慮した演算パイプラインスケジューリング手法を提案する.入力データの優先付けを工夫して,優先順位にしたがって投入タイミングを決定することで,スケジューリングへの影響を小さくする方法を提案する.評価の結果,ALAPスケジューリングと比較して平均7.6%のハードウェア量を削減することができた. |
| 抄録(英) | High-throughput circuit design under device resource constraints is important for FPGA-based biochemical simulators. In this papers, we propose novel arithmetic pipeline scheduling techniques which effectively reduce hardware costs under given input bandwidth constraints. By assigning data-input timing based on an appropriate priority, arithmetic scheduling process is hardly affected by input bandwidth constraints. Evaluation results revealed that our method reduces hardware costs by 7.6% on average compared to the conventional ALAP scheduling. |
| キーワード(和) | 生化学シミュレーション / 演算スケジューリング / FPGA |
| キーワード(英) | biochemical simulation / arithmetic scheduling / FPGA |
| 資料番号 | RECONF2008-20 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | RECONF |
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| 開催期間 | 2008/5/15(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
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| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Reconfigurable Systems (RECONF) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | FPGAを用いた生化学シミュレータにおける入力ポート制約を考慮した演算パイプラインスケジューリング(応用3) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Pipeline Scheduling with Input Port Constraints for an FPGA-based Biochemical Simulator |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 生化学シミュレーション / biochemical simulation |
| キーワード(2)（和/英） | 演算スケジューリング / arithmetic scheduling |
| キーワード(3)（和/英） | FPGA / FPGA |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 石森 智也 / Tomoya ISHIMORI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 長崎大学工学部 Faculty of Engineering, Nagasaki University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 山田 英樹 / Hideki YAMADA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 長崎大学工学部 Faculty of Engineering, Nagasaki University |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 柴田 裕一郎 / Yuichiro SHIBATA |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 長崎大学工学部 Faculty of Engineering, Nagasaki University |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 長名 保範 / Yasunori OSANA |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 慶應義塾大学理工学部 Faculty of Science and Technology, Keio University |
| 第 5 著者 氏名（和/英） | 吉見 真聡 / Masato YOSHIMI |
| 第 5 著者 所属（和/英） | 慶應義塾大学理工学部 Faculty of Science and Technology, Keio University |
| 第 6 著者 氏名（和/英） | 西川 由理 / Yuri NISHIKAWA |
| 第 6 著者 所属（和/英） | 慶應義塾大学理工学部 Faculty of Science and Technology, Keio University |
| 第 7 著者 氏名（和/英） | 小嶋 利紀 / Toshinori KOJIMA |
| 第 7 著者 所属（和/英） | 慶應義塾大学理工学部 Faculty of Science and Technology, Keio University |
| 第 8 著者 氏名（和/英） | 天野 英晴 / Hideharu AMANO |
| 第 8 著者 所属（和/英） | 慶應義塾大学理工学部 Faculty of Science and Technology, Keio University |
| 第 9 著者 氏名（和/英） | 舟橋 啓 / Akira FUNAHASHI |
| 第 9 著者 所属（和/英） | 慶應義塾大学理工学部 Faculty of Science and Technology, Keio University |
| 第 10 著者 氏名（和/英） | 広井 賀子 / Noriko HIROI |
| 第 10 著者 所属（和/英） | EMBL-EBI,Thornton group Wellcome Trust Genome Campus EMBL-EBI, Thornton group Wellcome Trust Genome Campus |
| 第 11 著者 氏名（和/英） | 小栗 清 / Kiyoshi OGURI |
| 第 11 著者 所属（和/英） | 長崎大学工学部 Faculty of Engineering, Nagasaki University |
| 発表年月日 | 2008-05-23 |
| 資料番号 | RECONF2008-20 |
| 巻番号（vol） | vol.108 |
| 号番号（no） | 48 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
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