| 講演名 | 2006-06-15 ベイジアンネットワークによる突然変異モデルの作成とBelief Propagationによる推定(機械学習によるバイオデータマインニング) 土井 慶紀, 村田 昇, |
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| 抄録(和) | 太古のDNA修復タンパク質は現在のものよりも活性が高かったと考えられており,そのタンパク質が得られれば,癌などに対する遺伝子治療に役立つ可能性がある.そこで,現在分かっているタンパク質のアミノ酸配列情報から,太古のタンパク質のアミノ酸配列を推定することを考えている.複数のタンパク質から,その祖先にあたるタンパク質を推定するための突然変異モデルを,ベイジアンネットワークを用いて作成し,従来のBelief Propagationを改変することで,提案モデルに適用できるようにした.また,cross-validationを用いて最適なパラメータの選択も行った.計算機上で仮想的に,ある祖先タンパク質から特定の突然変異確率に従うタンパク質を複数作成し,作成したタンパク質に提案モデルを適用する事で祖先配列を推定した.その精度評価について報告する. |
| 抄録(英) | It is thought that ancient DNA repair proteins were more active than present ones, and obtaining the ancient DNA repair proteins would be helpful for hereditary diseases such as cancer. We propose a mutation model using Bayesian Networks and a modified the belief propagation algorithm, which is applied to estimate an ancient protein from multiple proteins that are present. Also, we applied the cross-validation to derive an optimum parameter. We virtually generated multiple proteins from an ancient protein following a specific mutation probability, and evaluated our model by estimating the ancient protein by the proposed model. |
| キーワード(和) | ベイジアンネットワーク / ベイズ推定 / Belief Propagation / 突然変異モデル |
| キーワード(英) | Bayesian Networks / Bayes estimation / Belief Propagation / Mutation model |
| 資料番号 | NC2006-20 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2006/6/8(から1日開催) |
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| 開催地（英） | |
| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | ベイジアンネットワークによる突然変異モデルの作成とBelief Propagationによる推定(機械学習によるバイオデータマインニング) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Building a New Mutation Model based on Bayesian Networks and estimation by a modified Belief Propagation algorithm |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | ベイジアンネットワーク / Bayesian Networks |
| キーワード(2)（和/英） | ベイズ推定 / Bayes estimation |
| キーワード(3)（和/英） | Belief Propagation / Belief Propagation |
| キーワード(4)（和/英） | 突然変異モデル / Mutation model |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 土井 慶紀 / Yoshinori DOI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 早稲田大学大学院 理工学研究科 電気・情報生命専攻 Waseda University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 村田 昇 / Noboru MURATA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 早稲田大学 Waseda University |
| 発表年月日 | 2006-06-15 |
| 資料番号 | NC2006-20 |
| 巻番号（vol） | vol.106 |
| 号番号（no） | 101 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |