| 講演名 | 2006-06-15 BICモデル比較によるDNAマイクロアレイデータ正規化変換(機械学習によるバイオデータマインニング) 岡崎 威生, 神谷 円, 安富祖 仁, 名嘉村 盛和, |
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| 抄録(和) | DNAマイクロアレイデータは,実験に伴うノイズにより観測値が影響を受けやすいことが知られている。複数実験間の比較やデータ統合のためには,適切なバイアス補正による標準化が必要となる。これまで,理想データにおける分布の正規性を根拠に,特定の発現データに対し特定のバイアスを考慮した補正法が提案されてきた。本研究では想定される複数バイアスとその補正法の全組み合せをモデル化し,情報量基準BICにより最も適合したモデルを選出した上で正規化変換する手法を提案した。提案法をStanford MicroArray Databaseで提供されている酵母菌,マウス,ヒトのマイクロアレイデータに適用し,従来正規化法との比較実験結果を示した。 |
| 抄録(英) | DNA Microarray data, which are efficient for estimation and identification of genetic network, have a large variation due to those experimental environment and measurement. Standardization by an appropriate bias correction is needed for the comparison and the data integration between two or more experiments. On grounds of normality of distribution in the ideal expression data, some adjustment methods that considers a specific bias for specific expression data has been proposed. In this research, after all combinations of assumed multiple biases and the adjustment methods were modeled, and the appropriate model by BIG was selected for normalization of expression data. The proposal method was applied to a yeast, mouse, and human microarray data from Stanford MicroArray Database, and the comparison experiment result with previous methods was shown so far. |
| キーワード(和) | DNAマイクロアレイ / 遺伝子発現データ / 正規化 / BIC |
| キーワード(英) | DNA Microarray / Gene Expression data / Normailization / BIC |
| 資料番号 | NC2006-17 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2006/6/8(から1日開催) |
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| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | BICモデル比較によるDNAマイクロアレイデータ正規化変換(機械学習によるバイオデータマインニング) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Normalization of DNA Microarray data with BIG Model Comparison |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | DNAマイクロアレイ / DNA Microarray |
| キーワード(2)（和/英） | 遺伝子発現データ / Gene Expression data |
| キーワード(3)（和/英） | 正規化 / Normailization |
| キーワード(4)（和/英） | BIC / BIC |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 岡崎 威生 / Takeo OKAZAKI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 琉球大字工学部情報工学科 Information Engineering, Fucalty of Engineering, University of the Ryukyus |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 神谷 円 / Madoka KAMIYA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 琉球大学大学院理工学研究科情報工学専攻 Information Engineering, Graduate School of Science and Engineering, University of the Ryukyus |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 安富祖 仁 / Hitoshi AFUSO |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 琉球大学大学院理工学研究科情報工学専攻 Information Engineering, Graduate School of Science and Engineering, University of the Ryukyus |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 名嘉村 盛和 / Morikazu NAKAMURA |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 琉球大字工学部情報工学科 Information Engineering, Fucalty of Engineering, University of the Ryukyus |
| 発表年月日 | 2006-06-15 |
| 資料番号 | NC2006-17 |
| 巻番号（vol） | vol.106 |
| 号番号（no） | 101 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |