講演名 2006-05-24
木の編集距離の文字列の編集距離による近似
阿久津 達也, 深川 大路, 高須 淳宏,
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抄録(和) 木の類似度の尺度として、木の編集距離が20年以上前に提案され、それ以来、多くの研究が行われてきた。順序木に対する編集距離計算アルゴリズムとしては(入力の木のサイズをO(n)として)O(n^3 logn)のものが現時点で最速であるが、文字列の編集距離がO(n^2)時間で計算できることが知られている。そこで本研究では、木を文字列に変換して文字列の編集距離を計算することにより、木の編集距離を近似する方法を提案する。そして、入力される木の次数が限定されており、かつ、編集操作には単位コストがかかるという場合には、木の編集距離が変換後の文字列の編集距離の1/6以上かつ、O(n^<3/4>)以下となることを示す。
抄録(英) We present a method to transform an ordered and rooted tree of bounded degree into a string, where it is done by computing the Euler string of the tree with slight modifications. We show that the edit distance between trees is at least 1/6 and at most O(n^<3/4>) of the edit distance between the transformed strings, where we consider unit cost edit operations and n is the maximum size of two input trees.
キーワード(和) 編集距離 / 順序木 / オイラー文字列 / 近似アルゴリズム / 埋め込み
キーワード(英) tree edit distance / approximation / embedding / Euler string
資料番号 COMP2006-12
発行日

研究会情報
研究会 COMP
開催期間 2006/5/17(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Theoretical Foundations of Computing (COMP)
本文の言語 ENG
タイトル(和) 木の編集距離の文字列の編集距離による近似
サブタイトル(和)
タイトル(英) Approximating Tree Edit Distance Through String Edit Distance
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) 編集距離 / tree edit distance
キーワード(2)(和/英) 順序木 / approximation
キーワード(3)(和/英) オイラー文字列 / embedding
キーワード(4)(和/英) 近似アルゴリズム / Euler string
キーワード(5)(和/英) 埋め込み
第 1 著者 氏名(和/英) 阿久津 達也 / Tatsuya AKUTSU
第 1 著者 所属(和/英) 京都大学 化学研究所バイオインフォマティクスセンター
Bioinformatics Center, Institute for Chemical Research, Kyoto University
第 2 著者 氏名(和/英) 深川 大路 / Daiji FUKAGAWA
第 2 著者 所属(和/英) 国立情報学研究所
National Institute of Informatics
第 3 著者 氏名(和/英) 高須 淳宏 / Atsuhiro TAKASU
第 3 著者 所属(和/英) 国立情報学研究所
National Institute of Informatics
発表年月日 2006-05-24
資料番号 COMP2006-12
巻番号(vol) vol.106
号番号(no) 63
ページ範囲 pp.-
ページ数 8
発行日