| 講演名 | 2006-01-24 Distance Geometry問題の大域的最適化による解法について 臼居 亮二, 土居 伸二, 熊谷 貞俊, |
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| 抄録(和) | Distance Geometry問題とは, いくつかの原子から構成される分子に対して, 原子間距離からその構成原子の座標を計算する問題である. 本研究では, ガウス型目的関数を用いて最適化問題を解く方法, 確率的な解法を用いて最適化問題を解く方法, あるいはこれらを組み合わせた方法を用いて, Distance Geometry問題を解き, それぞれの解法の性能を詳細に比較する. 特に, タンパク質立体構造決定問題へ適用し, 我々の方法の有効性を示す. |
| 抄録(英) | The distance geometry problem is the problem that we calculate the coordinates of atoms from the distance data between atoms. In this research, we solve the distance geometry problem by utilizing the optimization technique by using a Gaussian objective function, the stochastic approach and the combination of these techniques, and compare each performance in detail. In particular, we apply these techniques to the determination of protein structures and show the effectiveness of our techniques. |
| キーワード(和) | Distance Geometry問題 / 大域的最適化 / ガウス型目的関数 / 分子構造 / スモールワールドネットワーク |
| キーワード(英) | distance geometry problem / global optimization / Gaussian objective function / molecular structure / stochastic proximity embedding / small-world network |
| 資料番号 | NLP2005-100 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NLP |
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| 開催期間 | 2006/1/17(から1日開催) |
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| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Nonlinear Problems (NLP) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | Distance Geometry問題の大域的最適化による解法について |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | On Global Optimization for Distance Geometry Problems |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | Distance Geometry問題 / distance geometry problem |
| キーワード(2)（和/英） | 大域的最適化 / global optimization |
| キーワード(3)（和/英） | ガウス型目的関数 / Gaussian objective function |
| キーワード(4)（和/英） | 分子構造 / molecular structure |
| キーワード(5)（和/英） | スモールワールドネットワーク / stochastic proximity embedding |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 臼居 亮二 / Ryoji USUI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院工学研究科 Graduate School of Engineering, Osaka University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 土居 伸二 / Shinji DOI |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院工学研究科 Graduate School of Engineering, Osaka University |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 熊谷 貞俊 / Sadatoshi KUMAGAI |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院工学研究科 Graduate School of Engineering, Osaka University |
| 発表年月日 | 2006-01-24 |
| 資料番号 | NLP2005-100 |
| 巻番号（vol） | vol.105 |
| 号番号（no） | 547 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |