講演名 2006-01-28
2次元電気泳動画像におけるタンパク質スポット位置の補正(ポスター2, 医用画像一般)
今野 祥生, 深見 忠典, 湯浅 哲也, 赤塚 孝雄,
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抄録(和) プロテオーム解析に重要な手法を提供する2次元ゲル電気泳動は, タンパク質の電荷と分子量の情報を2次元ゲル上のスポットにマップすることで, 複数のタンパク質を同時に特定できる.しかし現状では, 実験条件によりスポット位置が著しく変化するという問題がある.ゲル間での相対的なスポット位置が補正できれば, タンパク質特定の精度を高められる.ここでは, 既知のスポット間のマッチング関係を利用する位置補正処理について述べる.
抄録(英) 2-dimensional gel electrophoretogram (2-DE) can simultaneously features all proteins in cells according to the charge and molecular weight. Therefore, analysis of spots in 2-DE plays an important role in proteomics. However, spot position remarkably depends on experimental conditions, and cannot be specified uniquely. Establishment of registration algorithm between different 2-DEs will improve the accuracy of identification. In this research, we propose an algorithm of image registration for 2-DE using spot-correspondence between distinct gel images and geometrical transformation based on Delaunay triangulation, and show the effectiveness by applying the algorithm to actual 2-DE images.
キーワード(和) 2次元電気泳動ゲル / レジストレーション / 幾何学変換 / アイリスフィルタ / プロテオミクス
キーワード(英) 2-dimensional gel electrophoretogram / registration / geometrical transformation / Iris Filter / Proteomics
資料番号 MI2005-127
発行日

研究会情報
研究会 MI
開催期間 2006/1/21(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Medical Imaging (MI)
本文の言語 JPN
タイトル(和) 2次元電気泳動画像におけるタンパク質スポット位置の補正(ポスター2, 医用画像一般)
サブタイトル(和)
タイトル(英) Image registration algorithm for 2-D gel electrophoretogram of protein
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) 2次元電気泳動ゲル / 2-dimensional gel electrophoretogram
キーワード(2)(和/英) レジストレーション / registration
キーワード(3)(和/英) 幾何学変換 / geometrical transformation
キーワード(4)(和/英) アイリスフィルタ / Iris Filter
キーワード(5)(和/英) プロテオミクス / Proteomics
第 1 著者 氏名(和/英) 今野 祥生 / Sachio KONNO
第 1 著者 所属(和/英) 山形大学工学部
Faculty of Engineering, Yamagata University
第 2 著者 氏名(和/英) 深見 忠典 / Tadanori FUKAMI
第 2 著者 所属(和/英) 山形大学工学部
Faculty of Engineering, Yamagata University
第 3 著者 氏名(和/英) 湯浅 哲也 / Tetsuya YUASA
第 3 著者 所属(和/英) 山形大学工学部
Faculty of Engineering, Yamagata University
第 4 著者 氏名(和/英) 赤塚 孝雄 / Takao AKATSUKA
第 4 著者 所属(和/英) 山形大学工学部
Faculty of Engineering, Yamagata University
発表年月日 2006-01-28
資料番号 MI2005-127
巻番号(vol) vol.105
号番号(no) 580
ページ範囲 pp.-
ページ数 4
発行日