講演名 | 2006-01-28 2次元電気泳動画像におけるタンパク質スポット位置の補正(ポスター2, 医用画像一般) 今野 祥生, 深見 忠典, 湯浅 哲也, 赤塚 孝雄, |
---|---|
PDFダウンロードページ | PDFダウンロードページへ |
抄録(和) | プロテオーム解析に重要な手法を提供する2次元ゲル電気泳動は, タンパク質の電荷と分子量の情報を2次元ゲル上のスポットにマップすることで, 複数のタンパク質を同時に特定できる.しかし現状では, 実験条件によりスポット位置が著しく変化するという問題がある.ゲル間での相対的なスポット位置が補正できれば, タンパク質特定の精度を高められる.ここでは, 既知のスポット間のマッチング関係を利用する位置補正処理について述べる. |
抄録(英) | 2-dimensional gel electrophoretogram (2-DE) can simultaneously features all proteins in cells according to the charge and molecular weight. Therefore, analysis of spots in 2-DE plays an important role in proteomics. However, spot position remarkably depends on experimental conditions, and cannot be specified uniquely. Establishment of registration algorithm between different 2-DEs will improve the accuracy of identification. In this research, we propose an algorithm of image registration for 2-DE using spot-correspondence between distinct gel images and geometrical transformation based on Delaunay triangulation, and show the effectiveness by applying the algorithm to actual 2-DE images. |
キーワード(和) | 2次元電気泳動ゲル / レジストレーション / 幾何学変換 / アイリスフィルタ / プロテオミクス |
キーワード(英) | 2-dimensional gel electrophoretogram / registration / geometrical transformation / Iris Filter / Proteomics |
資料番号 | MI2005-127 |
発行日 |
研究会情報 | |
研究会 | MI |
---|---|
開催期間 | 2006/1/21(から1日開催) |
開催地(和) | |
開催地(英) | |
テーマ(和) | |
テーマ(英) | |
委員長氏名(和) | |
委員長氏名(英) | |
副委員長氏名(和) | |
副委員長氏名(英) | |
幹事氏名(和) | |
幹事氏名(英) | |
幹事補佐氏名(和) | |
幹事補佐氏名(英) |
講演論文情報詳細 | |
申込み研究会 | Medical Imaging (MI) |
---|---|
本文の言語 | JPN |
タイトル(和) | 2次元電気泳動画像におけるタンパク質スポット位置の補正(ポスター2, 医用画像一般) |
サブタイトル(和) | |
タイトル(英) | Image registration algorithm for 2-D gel electrophoretogram of protein |
サブタイトル(和) | |
キーワード(1)(和/英) | 2次元電気泳動ゲル / 2-dimensional gel electrophoretogram |
キーワード(2)(和/英) | レジストレーション / registration |
キーワード(3)(和/英) | 幾何学変換 / geometrical transformation |
キーワード(4)(和/英) | アイリスフィルタ / Iris Filter |
キーワード(5)(和/英) | プロテオミクス / Proteomics |
第 1 著者 氏名(和/英) | 今野 祥生 / Sachio KONNO |
第 1 著者 所属(和/英) | 山形大学工学部 Faculty of Engineering, Yamagata University |
第 2 著者 氏名(和/英) | 深見 忠典 / Tadanori FUKAMI |
第 2 著者 所属(和/英) | 山形大学工学部 Faculty of Engineering, Yamagata University |
第 3 著者 氏名(和/英) | 湯浅 哲也 / Tetsuya YUASA |
第 3 著者 所属(和/英) | 山形大学工学部 Faculty of Engineering, Yamagata University |
第 4 著者 氏名(和/英) | 赤塚 孝雄 / Takao AKATSUKA |
第 4 著者 所属(和/英) | 山形大学工学部 Faculty of Engineering, Yamagata University |
発表年月日 | 2006-01-28 |
資料番号 | MI2005-127 |
巻番号(vol) | vol.105 |
号番号(no) | 580 |
ページ範囲 | pp.- |
ページ数 | 4 |
発行日 |