| 講演名 | 2006-01-12 DPマッチングによるゲノムに内在する特徴パターン抽出の高速化 中川 匠, 吉原 郁夫, 山森 一人, 安永 守利, |
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| 抄録(和) | 塩基配列に含まれる未知の特徴パターンを探索するためにDPマッチングによるアラインメントを用いる. 塩基長nまでの特徴パターンを探索するためには, 長さN=2, 3, …, nの候補パターンについてDPマッチングを用いてアラインメントを求める必要がある. このときnを大きくすると候補パターンの数はO(4^ |
| 抄録(英) | Alignment based on DP-matching is used to extract unknown feature pattern embedded in genome sequence. To extract feature pattern with base length n, complete set of similarity of candidate pattern with base length N=2, 3, …, n is required. When extending base length n, number of candidate pattern and execution time increase exponential order O(4^ |
| キーワード(和) | ゲノム解析 / 動的計画法 / DPマッチング / アラインメント / 特徴抽出 |
| キーワード(英) | Genome Informatics / Dynamic Programming / DP-matching / Alignment / Feature Extraction |
| 資料番号 | CAS2005-83 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | CAS |
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| 開催期間 | 2006/1/5(から1日開催) |
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| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Circuits and Systems (CAS) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | DPマッチングによるゲノムに内在する特徴パターン抽出の高速化 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A Fast Method of Finding Unknown Feature Pattern Embedded in Genome Sequence by DP Matching |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | ゲノム解析 / Genome Informatics |
| キーワード(2)（和/英） | 動的計画法 / Dynamic Programming |
| キーワード(3)（和/英） | DPマッチング / DP-matching |
| キーワード(4)（和/英） | アラインメント / Alignment |
| キーワード(5)（和/英） | 特徴抽出 / Feature Extraction |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 中川 匠 / Takumi NAKAGAWA |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 宮崎大学工学研究科 Graduate School of Engineering, University of Miyazaki |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 吉原 郁夫 / Ikuo YOSHIHARA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 宮崎大学工学部 Faculty of Engineering, University of Miyazaki |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 山森 一人 / Kunihito YAMAMORI |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 宮崎大学工学部 Faculty of Engineering, University of Miyazaki |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 安永 守利 / Moritoshi YASUNAGA |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 筑波大学電子・情報工学系 Institute of Information Sciences and Electronics, University of Tsukuba |
| 発表年月日 | 2006-01-12 |
| 資料番号 | CAS2005-83 |
| 巻番号（vol） | vol.105 |
| 号番号（no） | 503 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
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