| 講演名 | 2002/7/19 制約付き混合主成分分析によるクラスタリング 吉岡 琢, 石井 信, |
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| 抄録(和) | 時系列データに対するクラスタ解析では,スケールにかかわらず,似た波形を持つデータが一つのクラスタに所属することが望まれる場合がある.本稿では,時系列データに対してそのようなクラスタリングを行うために,制約付き混合主成分分析(mixture of constrained probabilistic PCA, MCPCA)に基づく手法を提案する.提案手法では,波形が似ているデータはそのスケールにかかわらず同じクラスタに所属するとみなされる.一方で,スケールの小さいデータ(ノイズ成分が相対的に多く含まれていると考えられる)に対してロバストなクラスタリングが可能である.我々は,提案手法を遺伝子発現時系列パターンに対して適用した.結果として,統計的基準にしたがい生物学的に妥当なクラスタ数が得られた.さらに,クラスタリング結果のアンサンブルをとることによって,安定したクラスタ解析を実現できた,提案手法によって生物学的に意味のある時系列パターンを抽出することができた. |
| 抄録(英) | In a cluster analysis of time-series data, it is often required that data with similar patterns should be classified into the same cluster regardless of their magnitude (scale). In this article, we propose a clustering method for time-series data based on mixture of constrained PCAs (MCPCA). The proposed method is scale-insensitive, while keeping the robustness to noise possibly involved in expression patterns with a small magnitude. The proposed method was applied to a time-series gene expression data set. As a result, an appropriate number of clusters was determined based on a statistical criterion. Furthermore, by combining clustering results, robustness of the cluster analysis was achieved. Our method was able to caught biologically-meaningful expression patterns. |
| キーワード(和) | クラスタリング / 混合主成分分析 / 時系列データ / 変分ベイズ法 / バイオインフォマテイクス |
| キーワード(英) | clustering / mixture of probabilistic PCA / time-series data / variational Bayes / bioinformatics |
| 資料番号 | NC2002-37 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NC |
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| 開催期間 | 2002/7/19(から1日開催) |
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| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Neurocomputing (NC) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 制約付き混合主成分分析によるクラスタリング |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Clustering using mixture of constrained probabilistic PCA models |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | クラスタリング / clustering |
| キーワード(2)（和/英） | 混合主成分分析 / mixture of probabilistic PCA |
| キーワード(3)（和/英） | 時系列データ / time-series data |
| キーワード(4)（和/英） | 変分ベイズ法 / variational Bayes |
| キーワード(5)（和/英） | バイオインフォマテイクス / bioinformatics |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 吉岡 琢 / Taku YOSHIOKA |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科 Graduate School of Information Science |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 石井 信 / Shin ISHII |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科 Nara Institute of Science and Technology |
| 発表年月日 | 2002/7/19 |
| 資料番号 | NC2002-37 |
| 巻番号（vol） | vol.102 |
| 号番号（no） | 253 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |