| 講演名 | 2005-01-27 ベイジアンネットワークによる遺伝子ネットワーク推定(コンカレントシステム, 一般) 曹 貴美, 岡崎 威生, |
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| 抄録(和) | ベイジアンネットワークは, 変数間の因果関係や相関関係といった「依存関係」からネットワークを構築する確率ネットワークである. Directed Acyclic Graph(DAG)と, 条件付き確率によって構成される. 一方, バイオインフォマティクスの分野では, 遺伝子ネットワーク解析が研究課題の一つである. 遺伝子が他の遺伝子に影響を与えるという関係は, 各遺伝子を変数とみなした条件付き確率モデルによって表現できる. 本稿では, ベイジアンネットワークを用いた遺伝子ネットワークの推定を行う手順を提案する. 遺伝子ネットワークの解析に用いられている発現データは, ノイズの大きいものであることが一般に知られている. そこで生物学的知見など, 発現データ以外の情報を制約条件として考慮できるように手順を決定した. 提案した手順によって適切なグラフを選択できるかどうか検証するために評価実験を行ったので, この実験の結果も合わせて報告する. |
| 抄録(英) | The Bayesian network is a probability network which builds a network from the dependency of causal relationship and correlation between variables. It consists of DAG and conditional probability. On the other hand, in the field of bioinformatics, an analysis of genetic network is one of the research projects. A gene affects other genes. The conditional probability model which made each gene the variable can express this relation. In this paper, we propose the procedure of genetic network estimation with Bayesian network. It is known that the gene expression data used for analysis of a genetic network has large-scale noise. Then, this procedure can consider other information besides gene expression data as constraint. We also conducted the evaluation experiment for verifying whether suitable graph can be chosen with the procedure. So, the result of this experiment is also reported collectively. |
| キーワード(和) | ベイジアンネットワーク / 遺伝子ネットワーク / 行列表現 / DAG / 発現データ |
| キーワード(英) | Bayesian network / genetic network / matrix representation / DAG / gene expression data |
| 資料番号 | CST2004-43 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | CST |
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| 開催期間 | 2005/1/20(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Concurrent System Technology (CST) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | ベイジアンネットワークによる遺伝子ネットワーク推定(コンカレントシステム, 一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A basic study of genetic network estimation with Bayesian network |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | ベイジアンネットワーク / Bayesian network |
| キーワード(2)（和/英） | 遺伝子ネットワーク / genetic network |
| キーワード(3)（和/英） | 行列表現 / matrix representation |
| キーワード(4)（和/英） | DAG / DAG |
| キーワード(5)（和/英） | 発現データ / gene expression data |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 曹 貴美 / Kimi SO |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 琉球大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, University of the Ryukyus |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 岡崎 威生 / Takeo OKAZAKI |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 琉球大学工学部 Faculty of Engineering, University of the Ryukyus |
| 発表年月日 | 2005-01-27 |
| 資料番号 | CST2004-43 |
| 巻番号（vol） | vol.104 |
| 号番号（no） | 593 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 5 |
| 発行日 | |