| 講演名 | 2005-01-27 シグナル伝達経路解析のためのペトリネットに基づく形式的表現の提案(コンカレントシステム, 一般) 李 晨, 鈴木 俊一, 葛 崎偉, 中田 充, 松野 浩嗣, 宮野 悟, |
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| 抄録(和) | 本稿では、シグナル伝達経路の解析のためのペトリネットに基づく新しいモデリングおよび解析の手法を提案する。酵素の特性を表現するため、ペトリネットのモデルにおいて、"酵素プレース"という新しい表記法を導入する。初等T-invariantを繰り返し計算することで基本的な酵素成分を列挙していくことにより、シグナル伝達経路を求めるアルゴリズムを提案する。さらに本稿では、インターロイキン-3のシグナル伝達経路を例に挙げて、ペトリネットに基づくモデリングとシグナル伝達経路の解析方法を示す。 |
| 抄録(英) | In this research, we propose a new method for formulating and analyzing a signaling pathway with a focus on enzymes by applying Petri nets. In order to represent the properties of enzymes explicitly, we introduce a new notation "enzyme place" in the Petri net model. With enzyme places, we can give more natural description of signaling pathways than existing methods. Our method effectively finds basic enzymic components of a signaling pathway by employing T-invariants of Petri nets. This paper demonstrates how our method can be used in formulating and analyzing signaling pathways with an example of Interleukin-3 signaling pathway. |
| キーワード(和) | ペトリネット / 初等T-invariant / シグナル伝達経路 / モデリング / 酵素反応 |
| キーワード(英) | Petri net / elementary T-invariant / signaling pathway / modeling / enzyme reaction |
| 資料番号 | CST2004-39 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | CST |
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| 開催期間 | 2005/1/20(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Concurrent System Technology (CST) |
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| 本文の言語 | ENG |
| タイトル（和） | シグナル伝達経路解析のためのペトリネットに基づく形式的表現の提案(コンカレントシステム, 一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A New Proposal of Petri Net Based Formulation for Analyzing Signaling Pathways |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | ペトリネット / Petri net |
| キーワード(2)（和/英） | 初等T-invariant / elementary T-invariant |
| キーワード(3)（和/英） | シグナル伝達経路 / signaling pathway |
| キーワード(4)（和/英） | モデリング / modeling |
| キーワード(5)（和/英） | 酵素反応 / enzyme reaction |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 李 晨 / Chen LI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 鈴木 俊一 / Shunichi SUZUKI |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 山口大学大学院理工学研究科 Graduate School of Science and Engineering, Yamaguchi University |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 葛 崎偉 / Qi-Wei GE |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 山口大学教育学部 Faculty of Education, Yamaguchi University |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 中田 充 / Mitsuru NAKATA |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 山口大学教育学部 Faculty of Education, Yamaguchi University |
| 第 5 著者 氏名（和/英） | 松野 浩嗣 / Hiroshi MATSUNO |
| 第 5 著者 所属（和/英） | 山口大学理学部 Faculty of Science, Yamaguchi University |
| 第 6 著者 氏名（和/英） | 宮野 悟 / Satoru MIYANO |
| 第 6 著者 所属（和/英） | 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo |
| 発表年月日 | 2005-01-27 |
| 資料番号 | CST2004-39 |
| 巻番号（vol） | vol.104 |
| 号番号（no） | 593 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |