講演名 2002/9/13
興奮性チャンネルを構成する螺旋状円筒状タンパク分子相互干渉エネルギーの計算
平山 博史,
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抄録(和) 生体膜上に存在するイオンチャンネル孔の開閉機構を明らかにする目的で円筒状ポリペプチド間の相互ポテンシアル計算方法を考案した。イオンチャンネル孔は通常4つから5つのサブユニットから構成されさらにサブユニットは6こ程度の円筒状のポリペプチドからなる。その表面には螺旋を形成しながら帯電したアミノ酸基が配列されている。チャンネルが開閉するばあい、この円筒状のポリペプチドが変形する。本研究では螺旋状に配列された電荷を配する2この平行は円筒状のポリペプチド間の相互作用を解析する方法を提案する。ポテンシアルはVan der Waals 力を想定し、電荷同士の幾何学的関係を精密に解析した。本研究を発展させることで、イオンチャンネル開閉における生体分子変形の電気的および分子間力の解析が可能となると推定した。
抄録(英) We proposed a geometrical method to calculate the interaction potential among the cylindrical circular polypeptides that constitute the ion selective channel pore on the excitable biological membrane. An ion channel pore is composed of 5 to 6 subunits each of which is further constituted from 6 polypeptides. They carry negative electrical potentials on their surfaces with helical arrangement. When the channel transits between open and closed formation,the polypeptide deforms so as to minimize the potential field of an entire molecule of the channel. The present paper introduced a geometric method to characterize interaction among the helically distributed point charges on the polypeptides. We introduced the Van der Waals potential for characterizing the interaction among the channel composer cylindrical polypeptides.
キーワード(和) イオンチャンネル / 円筒状ポリペプチド / 相互ポテンシアル / Van der Waals分子間力
キーワード(英) Ion selective channel / Cylindrical circular polypeptides / interaction potential / Van der Waals force
資料番号 ED2002-202
発行日

研究会情報
研究会 ED
開催期間 2002/9/13(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Electron Devices (ED)
本文の言語 ENG
タイトル(和) 興奮性チャンネルを構成する螺旋状円筒状タンパク分子相互干渉エネルギーの計算
サブタイトル(和)
タイトル(英) Method for Calculating the Interaction (Van der Waals ) Potential among the Cylindrical Polypeptides that Carry Helically Arranged Point Charges on Their Surfaces.
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) イオンチャンネル / Ion selective channel
キーワード(2)(和/英) 円筒状ポリペプチド / Cylindrical circular polypeptides
キーワード(3)(和/英) 相互ポテンシアル / interaction potential
キーワード(4)(和/英) Van der Waals分子間力 / Van der Waals force
第 1 著者 氏名(和/英) 平山 博史 / H Hirayama
第 1 著者 所属(和/英) 旭川医科大学
Department of Public Health Asahikawa medical college.
発表年月日 2002/9/13
資料番号 ED2002-202
巻番号(vol) vol.102
号番号(no) 326
ページ範囲 pp.-
ページ数 7
発行日