| 講演名 | 1994/12/16 高速ゲノムスキャニングをめざした2次元電気泳動オートラジオグラムイメージの自動解析 渡辺 弥寿夫, 中沢 政幸, 堀岡 雅清, 林崎 良英, |
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| 抄録(和) | 本稿では、高速なゲノムスキャニングを目指して、先に開発されたRLGS(Restriction Landmark Genome Scanning)法をもとに2次元電気泳動法により得られたオートラジオグラム・イメージのパターン解析について述べている。画像処理の基本的課題は、主に(1)スポットの位置と濃度を検出すること、(2)微かなパターンの相異がある複数の画像間で照合・比較することである。ここでは、スポットの位置検出はリングオペレータを用い、スポット間の幾何学的構造は、RNG(Relative Neighbourhood Graph)で表現した。また、画像間の照合には、RNGと原画像上での階層的なパターン照合を利用した結果、処理効率の向上をはかることができた。実験の結果、我々の方法がRLGSパターンの自動解析装置を構築するのに有効であることが示された。 |
| 抄録(英) | We present the pattem analysis of autoradiogram images obtained with two-dimentional electrophoresis based on the RLGS(restriction landmark genome scanning)method developed by Hayashizaki et al.for the purpose of high-speed genome scanning.The basic problems of image processing for automated analysis are to detect the location of each spot and to measure its intensity.Some kinds of operator including the gradient and ring operators are used for solving the problem.Then the matching and comparison of the RLGS patterns is also important to analyze the differentiational state.This is solved by using relative neighbourhood graphs and hierachical pattern matching.Some experimental results indicate that our method is effective enough to construct an automatic analysis system of RLGS patterns. |
| キーワード(和) | ゲノム解析 / 2次元電気泳動 / RLGS法 / 画像処理 / パターンマッチング / 相 対隣接グラフ |
| キーワード(英) | genome analysis / two-dimensional electrophoresis / restriction landmark genomic scanning / image processing / pattern matching / relative neighbourhood graph |
| 資料番号 | PRU94-72 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | PRU |
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| 開催期間 | 1994/12/16(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Pattern Recognition and Understanding (PRU) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 高速ゲノムスキャニングをめざした2次元電気泳動オートラジオグラムイメージの自動解析 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Automated Analysis of Autoradiogram Images Using Two-Dimensional Electrophoresis for High-Speed Genome Scanning |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | ゲノム解析 / genome analysis |
| キーワード(2)（和/英） | 2次元電気泳動 / two-dimensional electrophoresis |
| キーワード(3)（和/英） | RLGS法 / restriction landmark genomic scanning |
| キーワード(4)（和/英） | 画像処理 / image processing |
| キーワード(5)（和/英） | パターンマッチング / pattern matching |
| キーワード(6)（和/英） | 相 対隣接グラフ / relative neighbourhood graph |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 渡辺 弥寿夫 / Yasuo Watanabe |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 金沢工業大学情報工学科 Department of Information and Computer Engineering,Kanazawa Institute of Technology |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 中沢 政幸 / Masayuki Nakazawa |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 石川職業能力開発短期大学校 Ishikawa Polytechnic College |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 堀岡 雅清 / Masakiyo Horioka |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 金沢工業大学電気工学科 Department of Electrical Engineering,Kanazawa Institute of Technology |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 林崎 良英 / Yoshihide Hayashizaki |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 理化学研究所筑波ライフサイエンスセンター Tsukuba Life Science Center,The Institute of Physical and Chemical Research |
| 発表年月日 | 1994/12/16 |
| 資料番号 | PRU94-72 |
| 巻番号（vol） | vol.94 |
| 号番号（no） | 423 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
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