| 講演名 | 2001/10/11 サポートベクトルマシンによるタンパク質局在部位の予測 吉岡 琢, 石井 信, |
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| 抄録(和) | タンパク質はDNAから転写, 翻訳の段階を経て合成される.合成後のタンパク質が正常に機能するためには、その種類に応じて細胞質、細胞膜, 細胞内小器官といった, 細胞内の適切な場所に運ばれる必要がある.これをタンパク質の局在化という.局在部位を決めるための情報は, タンパク質を構成するアミノ酸配列に含まれる.アミノ酸配列からタンパク質の局在部位を予測することができれば, その働きを推定することができる.局在部位の予測はパターン分類問題として定式化される.本研究では, サポートベクトルマシンによってアミノ酸配列から局在部位の予測を行う. |
| 抄録(英) | Proteins are synthesized from DNA through the processes of transcription and translation. After the synthesis, the proteins must be localized to appropriate sites in the cell, e.g., the nucleus, prasma membrane and organelles. This is the protein localization. Localization site of a protein depends on the amino acid sequence. We can get insigths about the function of a protein by predicting the localization site from the amino acid sequence. Prediction of protein localization sites is formalized as a pattern classification problem. In this study, we apply a support vector machine to predict localization sites of proteins based on their amino acid sequences. |
| キーワード(和) | タンパク質局在化 / サポートベクトルマシン / パターン認識 / 局在化シグナル / アミノ酸出現頻度 |
| キーワード(英) | protein localization / support vector machine / pattern classification / localization signal / amino acid composition |
| 資料番号 | PRMU2001-107,NC2001-57 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | PRMU |
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| 開催期間 | 2001/10/11(から1日開催) |
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| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Pattern Recognition and Media Understanding (PRMU) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | サポートベクトルマシンによるタンパク質局在部位の予測 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Prediction of protein localization sites by a support vector machine |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | タンパク質局在化 / protein localization |
| キーワード(2)（和/英） | サポートベクトルマシン / support vector machine |
| キーワード(3)（和/英） | パターン認識 / pattern classification |
| キーワード(4)（和/英） | 局在化シグナル / localization signal |
| キーワード(5)（和/英） | アミノ酸出現頻度 / amino acid composition |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 吉岡 琢 / Taku Yoshioka |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 奈良先端科学技術大学院大学 Nara Institute of Science and Technology |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 石井 信 / Shin Ishii |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 奈良先端科学技術大学院大学 Nara Institute of Science and Technology |
| 発表年月日 | 2001/10/11 |
| 資料番号 | PRMU2001-107,NC2001-57 |
| 巻番号（vol） | vol.101 |
| 号番号（no） | 362 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 8 |
| 発行日 | |