講演名 2000/5/4
蛋白質2次元電気泳動パターン自動解析システムの開発
高橋 勝利, 中沢 政幸, 小長谷 明彦, 渡辺 弥寿夫,
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抄録(和) 近年、ポスト・ゲノム・シークエンシング研究として注目されている「プロテオーム解析」において、中心的な技術として位置付けられる蛋白質2次元電気泳動の、パターン解析を自動的に行うことを可能にするコンピュータ・アルゴリズム及び解析システムを開発した。我々のアルゴリズムを適用すると、歪みを有する蛋白質2次元電気泳動画像から蛋白質スポット情報を自動抽出し、さらに複数の2次元電気泳動パターンの自動照合後、スポット情報の整理統合を自動的に行うことが可能となる。また、WWW(World Wide Web)インターフェイスを介して、コンピュータ・ネットワーク経由で電気泳動画像の収集・画像データベース構築から解析までを一元的に行う蛋白質2次元電気泳動パターン解析システム"PiKA^2"の概要を紹介する。
抄録(英) We have established the automated processing algorithm which deals with the images of protein 2-dimensional poly-acrylamide gel electrophoresis (2D-PAGE) , which is thought to be a key technology in "proteome"analysis. Our processing algorithm automatically extracts the locations and intensities of the protein spots separated and visualized in 2D-PAGE, then automatically compare the huge number of such images. We have also developed a WWW (World Wide Web) based 2D-PAGE image processing system "PiKA^2", which realizes automated 2D-PAGE image submission, automated spot detection and automated spot pattern comparison via computer network with WWW browser.
キーワード(和) プロテオーム解析 / 2D-PAGE / 画像処理 / パターン照合 / 自動解析
キーワード(英) Proteome analysis / 2-D PAGE / Image processing / Pattern matching / Automated analysis
資料番号 PRMU2000-11, MI2000-11
発行日

研究会情報
研究会 MI
開催期間 2000/5/4(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Medical Imaging (MI)
本文の言語 JPN
タイトル(和) 蛋白質2次元電気泳動パターン自動解析システムの開発
サブタイトル(和)
タイトル(英) Automated Processing System of Protein 2D-PAGE Images
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) プロテオーム解析 / Proteome analysis
キーワード(2)(和/英) 2D-PAGE / 2-D PAGE
キーワード(3)(和/英) 画像処理 / Image processing
キーワード(4)(和/英) パターン照合 / Pattern matching
キーワード(5)(和/英) 自動解析 / Automated analysis
第 1 著者 氏名(和/英) 高橋 勝利 / Katsutoshi Takahashi
第 1 著者 所属(和/英) 北陸先端科学技術大学院大学
Japan Advanced Institute of Science and Technology, Hokuriku
第 2 著者 氏名(和/英) 中沢 政幸 / Masayuki Nakazawa
第 2 著者 所属(和/英) 金沢工業高等専門学校
Kanazawa Technical College
第 3 著者 氏名(和/英) 小長谷 明彦 / Akihiko Konagaya
第 3 著者 所属(和/英) 北陸先端科学技術大学院大学
Japan Advanced Institute of Science and Technology, Hokuriku
第 4 著者 氏名(和/英) 渡辺 弥寿夫 / Yasuo Watanabe
第 4 著者 所属(和/英) 金沢工業大学
Kanazawa Institute of Technology
発表年月日 2000/5/4
資料番号 PRMU2000-11, MI2000-11
巻番号(vol) vol.100
号番号(no) 45
ページ範囲 pp.-
ページ数 8
発行日