| 講演名 | 2000/5/4 DNAマイクロアレイ画像の解析 太田 直哉, 蜂須 洋平, 阿久津 達也, 藤山 秋佐夫, |
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| 抄録(和) | 生物の遺伝子の発現状態を知る方法の一つに、DNAマイクロアレイを用いる方法がある。この方法は多数の遺伝子の発現状態を同時に測定する効率の良い方法として期待されているが、この特徴を生かすためには、その画像の処理を自動化する必要がある。本論文ではそのための画像処理について述べる。DNAマイクロアレイの画像はスポットが規則的に並んでおり、各々のスポットの濃度が異なる遺伝子の発現状態を表している。したがって、必要とされる画像処理は各々のスポットの位置を決定し、その濃度を計測することである。まず、画像の画素値のピークを検出することによってスポットの候補を得る。次にそれらの射影を用いてスポットの配列の位置と角度を決定し、正しいスポットを選別する。さらに画像の濃度ヒストグラムにより背景のレベルを推定した後、最終的にスポットの濃度を計測する。 |
| 抄録(英) | DNA micorarray is known as a method to obtain information of many different genes by one experiment. In order to effectively use this method, however. we need to automate the image processing part of the method. We describe an image processing algorithm for this purpose. A DNA micorarray image consists of a lot of spots regularly placed in a grid shape. The intensity of each spot corresponds to activeness of a specific gene. Therefore, the function of the image processing algorithm is to identify each spot and to measure its intensity. The algorithm first detects candidates of the spots and determines the angle and position of the grid formed by the spots. Then, it selects correct spots from the candidates using the information of the grid position. Next, the algorithm estimates the background levels of the image by intensity histograms and measure the intensity of each spot. |
| キーワード(和) | DNAマイクロアレイ / 遺伝子ネットワーク / スポット検出 / 直線検出 / 背景レベル推定 |
| キーワード(英) | DNA microarray / gene network / spot detection / line detection / background level estimation |
| 資料番号 | PRMU2000-9, MI2000-9 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MI |
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| 開催期間 | 2000/5/4(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
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| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
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| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Medical Imaging (MI) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | DNAマイクロアレイ画像の解析 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Analysis of DNA Microarray Images |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | DNAマイクロアレイ / DNA microarray |
| キーワード(2)（和/英） | 遺伝子ネットワーク / gene network |
| キーワード(3)（和/英） | スポット検出 / spot detection |
| キーワード(4)（和/英） | 直線検出 / line detection |
| キーワード(5)（和/英） | 背景レベル推定 / background level estimation |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 太田 直哉 / Naoya Ohta |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 群馬大学工学部 Gunma University |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 蜂須 洋平 / Youhei Hachisu |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 群馬大学工学部 Gunma University |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 阿久津 達也 / Tatsuya Akutsu |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 東京大学医科学研究所 University of Tokyo |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 藤山 秋佐夫 / Asao Fujiyama |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 国立遺伝学研究所 National Institute of Genetics |
| 発表年月日 | 2000/5/4 |
| 資料番号 | PRMU2000-9, MI2000-9 |
| 巻番号（vol） | vol.100 |
| 号番号（no） | 45 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 8 |
| 発行日 | |