| 講演名 | 2003/6/19 DNAマイクロアレイデータによるオペロン構造予測 : ベイズ的階層モデルを応用したアプローチ(バイオインフォマティクスとパターン認識) 清水 仁, 大羽 成征, 石井 信, |
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| 抄録(和) | 原核生物にはオペロンと呼ばれる転写単位が存在する。オペロンでは機能に関連がある遺伝子がひとまとまりになっている場合が多いため、ゲノム中のオペロン構造を知ることはポストゲノムシーケンス研究において遺伝子の機能を予測する上で有用である。我々は、DNAマイクロアレイデータにおける遺伝子間の相関関係とオペロン構造とを繋ぐベイズ的階層モデルを用いて、オペロン構造を予測した。我々の手法は従来手法を上まわる正解率を示した。 |
| 抄録(英) | An operon is a transcriptional unit in prokaryotes. Genes belonging to a single operon often exhibit related biological functions to each other. Therefore prediction of operon structure is beneficial for prediction of biological functions of genes. We have developed a method that predicts the operon structure using DNA microarray data. Our method is based on a Bayesian hierarchical model. As a consequence, our method has shown higher prediction performance than a conventional method based on a correlation analysis. |
| キーワード(和) | DNAマイクロアレイ / オペロン / ベイズ的階層モデル |
| キーワード(英) | DNA microarray / operon / Bayesian hierarchical model |
| 資料番号 | PRMU2003-30 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | PRMU |
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| 開催期間 | 2003/6/19(から1日開催) |
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| テーマ（和） | |
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| 委員長氏名（和） | |
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| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Pattern Recognition and Media Understanding (PRMU) |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | DNAマイクロアレイデータによるオペロン構造予測 : ベイズ的階層モデルを応用したアプローチ(バイオインフォマティクスとパターン認識) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Operon Prediction by DNA microarray : an Approach with a Bayesian Hierarchical Model |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | DNAマイクロアレイ / DNA microarray |
| キーワード(2)（和/英） | オペロン / operon |
| キーワード(3)（和/英） | ベイズ的階層モデル / Bayesian hierarchical model |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 清水 仁 / Hitoshi SHIMIZU |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 奈良先端科学技術大学院大学 Nara Institute of Science and Technology |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 大羽 成征 / Shigeyuki OBA |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 奈良先端科学技術大学院大学 Nara Institute of Science and Technology |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 石井 信 / Shin ISHII |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 奈良先端科学技術大学院大学 Nara Institute of Science and Technology |
| 発表年月日 | 2003/6/19 |
| 資料番号 | PRMU2003-30 |
| 巻番号（vol） | vol.103 |
| 号番号（no） | 150 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |