講演名 2003/3/10
カーネルマシンによる複数情報源からのイースト菌遺伝子機能予測
宇田 新介, 津田 宏治,
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抄録(和) カーネルマシンは統計的データ処理においてその有用性が認められており,一般にひとつのタイプのデータから得られたひとつのカーネル行列を基に動作する.しかし,遺伝子やたんぱく質などの生物学的な対象は,複数タイプのデータで表現されることが多い.カーネルマシンの適用において,複数タイプのデータを有効利用する方法のひとつに,データのタイプごとに得られる複数のカーネル行列をひとつの行列にまとめる方法が考えられる.本研究では,複数のカーネル行列の線形和を用いてひとつのカーネル行列を作り,重みを教師有りで学習する手法を提案する.イースト菌遺伝子機能予測問題に対して提案手法による実験を行い,手法の有効性について検討を行った.
抄録(英) In biology, it is often the case that objects are expressed as combination of multiple data which are individually taken from different information sources. In such cases, it can be expected that appropriately combining information from the multiple data would improve the performance for classifying the objects into several categories, compared with simple methods which employ only one of the data. In this paper, we introduce this naive idea into the so-called kernel classification scheme linearly combining multiple kernels. Efficacy of the proposed scheme is experimentally examined for gene prediction.
キーワード(和) カーネル法 / 線形行列不等式 / クラス分類 / 複数情報源 / 生命情報科学
キーワード(英) Kernel method / Linear Matrix Inequality / Classification / Multiple Source Information / Computational Biology
資料番号 NC2002-159
発行日

研究会情報
研究会 NC
開催期間 2003/3/10(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Neurocomputing (NC)
本文の言語 JPN
タイトル(和) カーネルマシンによる複数情報源からのイースト菌遺伝子機能予測
サブタイトル(和)
タイトル(英) Gene Function Classification by Linear Combination of Kernel Matrices based on Multiple Information Sources
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) カーネル法 / Kernel method
キーワード(2)(和/英) 線形行列不等式 / Linear Matrix Inequality
キーワード(3)(和/英) クラス分類 / Classification
キーワード(4)(和/英) 複数情報源 / Multiple Source Information
キーワード(5)(和/英) 生命情報科学 / Computational Biology
第 1 著者 氏名(和/英) 宇田 新介 / Shinsuke UDA
第 1 著者 所属(和/英) 東京工業大学大学院総合理工学研究科
Graduate School of Science and Engineering Tokyo Institute of Technology
第 2 著者 氏名(和/英) 津田 宏治 / Koji TSUDA
第 2 著者 所属(和/英) 産業技術総合研究所 生命科学研究センター
Graduate School of Science and Engineering Tokyo Institute of Technology
発表年月日 2003/3/10
資料番号 NC2002-159
巻番号(vol) vol.102
号番号(no) 729
ページ範囲 pp.-
ページ数 6
発行日