| 講演名 | 2004-09-14 ガウス型目的関数を用いた最適化による分子構造の推定(通信システム・非線形回路とシステム及び一般) 臼居 亮二, 土居 伸二, 熊谷 貞俊, |
|---|---|
| PDFダウンロードページ |  PDFダウンロードページへ |
| 抄録(和) | タンパク質の3次元立体構造を決定することは,生命現象の解明,医薬品の開発等において重要である.タンパク質の構造は,主にNMR解析やX線結晶解析により解析される.NMR解析では,タンパク質を構成する原子間の距離データが得られる.原子間距離データから原子の座標を決定する問題は, Distance geometry problem と呼ばれる.本研究では,ガウス型目的関数を提案し,その目的関数の最適化問題を解くことによりタンパク質の立体構造決定を行う. |
| 抄録(英) | It is important to determine a three-dimensional protein structure in the elucidation of biological phenomena, the development of drug medicines, etc. The conformations of proteins are mainly analyzed by the NMR (Nuclear Magnetic Resonance) spectroscopy and the X-ray crystallography. In the NMR spectroscopy, distance data among some atoms are approximately given, and a protein structure is determined by solving the so-called distance geometry problem. In this research, we propose a gaussian objective function and determine the protein conformation by solving the global optimization problem of the objective function. |
| キーワード(和) | タンパク質 / 立体構造 / distance geometry problem / ガウス型目的関数 / 大域的最適化 |
| キーワード(英) | protein / conformation / distance geometry problem / gaussian objective function / global optimization |
| 資料番号 | CAS2004-33,NLP2004-45 |
| 発行日 |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | CAS |
|---|---|
| 開催期間 | 2004/9/7(から1日開催) |
| 開催地（和） | |
| 開催地（英） | |
| テーマ（和） | |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | |
| 委員長氏名（英） | |
| 副委員長氏名（和） | |
| 副委員長氏名（英） | |
| 幹事氏名（和） | |
| 幹事氏名（英） | |
| 幹事補佐氏名（和） | |
| 幹事補佐氏名（英） | |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Circuits and Systems (CAS) |
|---|---|
| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | ガウス型目的関数を用いた最適化による分子構造の推定(通信システム・非線形回路とシステム及び一般) |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | The Determination of Molecular Structures by the Optimization with a Gaussian Objective Function |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | タンパク質 / protein |
| キーワード(2)（和/英） | 立体構造 / conformation |
| キーワード(3)（和/英） | distance geometry problem / distance geometry problem |
| キーワード(4)（和/英） | ガウス型目的関数 / gaussian objective function |
| キーワード(5)（和/英） | 大域的最適化 / global optimization |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 臼居 亮二 / Ryoji USUI |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院 Osaka University Graduate School |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 土居 伸二 / Shinji DOI |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院 Osaka University Graduate School |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 熊谷 貞俊 / Sadatoshi KUMAGAI |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 大阪大学大学院 Osaka University Graduate School |
| 発表年月日 | 2004-09-14 |
| 資料番号 | CAS2004-33,NLP2004-45 |
| 巻番号（vol） | vol.104 |
| 号番号（no） | 293 |
| ページ範囲 | pp.- |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | |