講演名 2004/9/6
発現時間を考慮した遺伝子ネットワークの相互作用推定(通信システム・非線形回路とシステム及び一般)
中山 英生, 田中 寛人, 潮 俊光,
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抄録(和) 本報告では,遺伝子ネットワークモデルの1つである連続時間スイッチングネットワークを対象とする.本モデルにおいて,遺伝子の発現バターン列から遺伝子間の相互作用パラメータを推定する方法は市瀬と合原によって提案されている.しかし,各発現パターンが持続する時間をも考慮することができれば,より正確なパラメータ推定が可能になると考えられる.そこで本報告では,遺伝子の発現パターン列と各発現バターンの発現時間から,遺伝子間の相互作用パラメータを推定する方法を提案し,適用例を示す.
抄録(英) In this report, we consider a continuous-time switching network, which is one of gene network models. In this model, Ichinose and Aihara proposed a method for estimating interaction parameters among genes by using a specified gene expression pattern sequence. However, if duration time of each gene expression pattern in the specified sequence can be taken into consideration, more exact estimation will be possible. Therefore, in this report, we will propose a new method for estimating the interaction parameters by using a specified gene expression sequence and the duration time, and show an example.
キーワード(和) 遺伝子ネヅトワーク / 連続時間スイッチングネットワーク / 相互作用推定 / 発現時間 / 線形計画問題
キーワード(英) gene networks / continuous-time switching networks / estimation of interaction / expression times / linear programming
資料番号 CAS200421,NLP2004-33
発行日

研究会情報
研究会 CAS
開催期間 2004/9/6(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Circuits and Systems (CAS)
本文の言語 JPN
タイトル(和) 発現時間を考慮した遺伝子ネットワークの相互作用推定(通信システム・非線形回路とシステム及び一般)
サブタイトル(和)
タイトル(英) Estimation of Interaction in a Gene Network using Expression Times
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) 遺伝子ネヅトワーク / gene networks
キーワード(2)(和/英) 連続時間スイッチングネットワーク / continuous-time switching networks
キーワード(3)(和/英) 相互作用推定 / estimation of interaction
キーワード(4)(和/英) 発現時間 / expression times
キーワード(5)(和/英) 線形計画問題 / linear programming
第 1 著者 氏名(和/英) 中山 英生 / Hideki NAKAYAMA
第 1 著者 所属(和/英) 大阪大学大学院基礎工学研究科
Graduate School of Engineering Science, Osaka University
第 2 著者 氏名(和/英) 田中 寛人 / Hiroto TANAKA
第 2 著者 所属(和/英) 大阪大学大学院基礎工学研究科
Graduate School of Engineering Science, Osaka University
第 3 著者 氏名(和/英) 潮 俊光 / Toshimitsu USHIO
第 3 著者 所属(和/英) 大阪大学大学院基礎工学研究科
Graduate School of Engineering Science, Osaka University
発表年月日 2004/9/6
資料番号 CAS200421,NLP2004-33
巻番号(vol) vol.104
号番号(no) 292
ページ範囲 pp.-
ページ数 4
発行日