講演名 2003/9/7
サポートベクタマシンを用いた薬物の活性クラス分類(<特集>「アクティブマイニング」及び一般)
高橋 由雅, 錦織 克美, 藤島 悟志,
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抄録(和) 本研究では,化学構造情報にもとづく薬物活性クラス分類へのサポートベクタマシンの有用性について,実データを用いて検証した.個々の薬物の構造情報の数値的記述表現には先に筆者らが報告したトポロジカルフラグメントスペクトル法を用いた.実験に際しては市販の治験薬構造データベース(MDDR, Molecular Design Drug Data Report)より,異なる受容体(D1, D2, D3, D4)に作用する1364種のドーパミン桔抗薬を抽出し,用いた.全化合物の90% (1228化合物)を訓練集合として学習を行った後,残り136化合物を予測集合として実験を行ったところ89.8%の化合物について活性クラスを正しく予測することができた.
抄録(英) In the present work, we investigated an applicability of Support Vector Machine (SVM) for classification of pharmacological activities of drugs. The numerical description of chemical structure of each drug was based the Topological Fragment Spectra (TFS) which was reported in our preceding work. Dopamine antagonists of 1,228 that interact with different type of receptors (D1, D2, D3 and D4) were used for training the SVM. For a prediction set of 136 drugs that were not contained in the training set, the SVM model classified 89.8% of the drugs into their own activity classes correctly.
キーワード(和) パタン分類 / サポートベクタマシン / ドーパミン桔抗薬 / ポロジカルフラグメントスペクトル / 構造活性相関 / リスクレポート
キーワード(英) Pattern Classification / SVM / Dopamine Antagonists / Topological Fragment Spectra / Structure-Activity Relationship / Risk Report
資料番号 AI2003-42
発行日

研究会情報
研究会 AI
開催期間 2003/9/7(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Artificial Intelligence and Knowledge-Based Processing (AI)
本文の言語 ENG
タイトル(和) サポートベクタマシンを用いた薬物の活性クラス分類(<特集>「アクティブマイニング」及び一般)
サブタイトル(和)
タイトル(英) Classification of Pharmacological Activity of Drugs Using Support Vector Machines
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) パタン分類 / Pattern Classification
キーワード(2)(和/英) サポートベクタマシン / SVM
キーワード(3)(和/英) ドーパミン桔抗薬 / Dopamine Antagonists
キーワード(4)(和/英) ポロジカルフラグメントスペクトル / Topological Fragment Spectra
キーワード(5)(和/英) 構造活性相関 / Structure-Activity Relationship
キーワード(6)(和/英) リスクレポート / Risk Report
第 1 著者 氏名(和/英) 高橋 由雅 / Yoshimasa TAKAHASHI
第 1 著者 所属(和/英) 豊橋技術科学大学知識情報工学系
Department of Knowledge-based Inforamtion Engineering, Toyohashi University of Technology
第 2 著者 氏名(和/英) 錦織 克美 / Katsumi NISHIKOORI
第 2 著者 所属(和/英) 豊橋技術科学大学知識情報工学系
Department of Knowledge-based Inforamtion Engineering, Toyohashi University of Technology
第 3 著者 氏名(和/英) 藤島 悟志 / Satoshi FUJISHIMA
第 3 著者 所属(和/英) 豊橋技術科学大学知識情報工学系
Department of Knowledge-based Inforamtion Engineering, Toyohashi University of Technology
発表年月日 2003/9/7
資料番号 AI2003-42
巻番号(vol) vol.103
号番号(no) 304
ページ範囲 pp.-
ページ数 4
発行日