講演名 2002/5/17
シグナル伝達と仮説推論バイオインフォマティクスでの応用事例(<特集>自動推論 : 演繹, 帰納, モデル検査/生成, 仮説推論アブダクション, 論理プログラム, プランニング, 時相論理, etc.)
福田 賢一郎,
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抄録(和) 複数のシグナル伝達パスウェイがお互いにどのように関わり合うかを明らかにすることは、外界に応答する細胞のメカニズムを解明する上で重要である。しかしながら、蓄積された個別の知見を組み合わせて生物学的に妥当な知識を導くための形式的な手法が確立されていない。本研究報告では、生物学者が行っている"生物学的に正しい推論"を事例ベースに対する仮説推論としてモデル化し、知識ベース上で妥当な推論を行うシステムの設計に関して論じる。.生物学者が正しい新規知識を獲得するプロセスを背景知識と実験データに矛盾しないで観測事実を説明する仮説の獲得行為としてモデル化し、論理に基づく仮説推論の枠組みを応用した。
抄録(英) Interplay of Signal Transduction Pathways is a key to prove an integrated response to total signal inputs to the cell. However, formal methods to put distinct pathways into a single biologically valid context are unknown. As a result, our knowledge remains to be a huge archive of small fragmented pathways. To overcome this situation, an intelligent system that stores information about every pathway reported in articles and provides functions to infer possible pathways that satisfy a certain set of constraints, such as observations of biological experiments, is required. This report introduces a prototype system based on the hypothetical reasoning framework that infers possible explanations of cross-talk pathways.
キーワード(和) 細胞内シグナル伝達経路 / 知識表現 / 仮説推論 / 演繹データベース
キーワード(英) signal transduction pathway / knowledge representation / hypothetical reasoning / deductive database
資料番号 AI2002-11
発行日

研究会情報
研究会 AI
開催期間 2002/5/17(から1日開催)
開催地(和)
開催地(英)
テーマ(和)
テーマ(英)
委員長氏名(和)
委員長氏名(英)
副委員長氏名(和)
副委員長氏名(英)
幹事氏名(和)
幹事氏名(英)
幹事補佐氏名(和)
幹事補佐氏名(英)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Artificial Intelligence and Knowledge-Based Processing (AI)
本文の言語 ENG
タイトル(和) シグナル伝達と仮説推論バイオインフォマティクスでの応用事例(<特集>自動推論 : 演繹, 帰納, モデル検査/生成, 仮説推論アブダクション, 論理プログラム, プランニング, 時相論理, etc.)
サブタイトル(和)
タイトル(英) Signal Transduction and Hypothetical Reasoning application in bioinformatics
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) 細胞内シグナル伝達経路 / signal transduction pathway
キーワード(2)(和/英) 知識表現 / knowledge representation
キーワード(3)(和/英) 仮説推論 / hypothetical reasoning
キーワード(4)(和/英) 演繹データベース / deductive database
第 1 著者 氏名(和/英) 福田 賢一郎 / Ken-ichiro FUKUDA
第 1 著者 所属(和/英) 産業技術総合研究所生命情報科学研究センター
Computational Biology Research Center (CBRC), National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST)
発表年月日 2002/5/17
資料番号 AI2002-11
巻番号(vol) vol.102
号番号(no) 91
ページ範囲 pp.-
ページ数 6
発行日