講演名 2019-01-23
畳み込みニューラルネットワークを用いたヒトiPS由来心筋細胞の品質管理
折田 健(東大), 澤田 光平(東大), 池谷 裕二(東大),
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抄録(和) 創薬過程において、薬物による心臓への毒性は主要な開発撤退理由の一つである。この原因の一つとして、従来の細胞や動物を用いたモデルは種差の違いが原因で安全性薬理試験に適さないことが挙げられる。近年では、従来の評価系の問題を克服可能なモデルとして、ヒトiPS由来心筋細胞を用いた評価系の開発が盛んである。しかし、細胞の品質が不均一であるため、再現性の確保のために細胞の品質管理を行う必要がある。本研究では畳み込みニューラルネットワークを用いて、ヒトiPS由来心筋細胞の品質の自動判別を検討した。その結果、平均約 0.88のF1値で予測を行うことができた。これにより、畳み込みニューラルネットワークがヒトiPS由来心筋細胞の品質管理に有用であることが示唆された。
抄録(英) Drug induced cardiotoxicity is one of the main reasons for drug attrition. It is partially because the conventional models were inappropriate for safety pharmacology studies due to species differences. In recent years human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes (hiPSC-CMs) were developed and tried to use in place of the conventional models. However, the quality of hiPSC-CMs is heterogenous and therefore needs to be controlled for reproducibility. In this study we used convolutional neural network for quality control of hiPSC-CMs and could predict with an average of about 0.88 F1-score. This suggests that CNN is useful for quality control of hiPSC-CMs.
キーワード(和) CNN / ヒトiPS由来心筋細胞 / 品質管理 / 創薬
キーワード(英) CNN / hiPSC-CMs / Quality Control / Drug Development
資料番号 NC2018-42
発行日 2019-01-16 (NC)

研究会情報
研究会 NLP / NC
開催期間 2019/1/23(から2日開催)
開催地(和) 北海道大学 百年記念会館
開催地(英) The Centennial Hall, Hokkaido Univ.
テーマ(和) ニューロコンピューティングの実装および人間科学のための解析・モデル化,一般
テーマ(英) General Implementation of Neuro Computing, Analysis and Modeling of Human Science, etc.
委員長氏名(和) 高橋 規一(岡山大) / 平田 豊(中部大)
委員長氏名(英) Norikazu Takahashi(Okayama Univ.) / Yutaka Hirata(Chubu Univ.)
副委員長氏名(和) 黒川 弘章(東京工科大) / 庄野 逸(電通大)
副委員長氏名(英) Hiroaki Kurokawa(Tokyo Univ. of Tech.) / Hayaru Shouno(UEC)
幹事氏名(和) 山内 将行(広島工大) / 木村 貴幸(日本工大) / 吉川 大弘(名大) / 吉本 潤一郎(奈良先端大)
幹事氏名(英) Masayuki Yamauchi(Hiroshima Inst. of Tech.) / Takayuki Kimura(Nippon Inst. of Tech.) / Tomohiro Yoshikawa(Nagoya Univ.) / Junichiro Yoshimoto(NAIST)
幹事補佐氏名(和) 木村 真之(京大) / 島田 裕(埼玉大) / 稲垣 圭一郎(中部大) / 篠崎 隆志(NICT)
幹事補佐氏名(英) Masayuki Kimura(Kyoto Univ.) / Yutaka Shimada(Saitama Univ.) / Keiichiro Inagaki(Chubu Univ.) / Takashi Shinozaki(NICT)

講演論文情報詳細
申込み研究会 Technical Committee on Nonlinear Problems / Technical Committee on Neurocomputing
本文の言語 JPN
タイトル(和) 畳み込みニューラルネットワークを用いたヒトiPS由来心筋細胞の品質管理
サブタイトル(和)
タイトル(英) Quality control of human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes using convolutional neural network
サブタイトル(和)
キーワード(1)(和/英) CNN / CNN
キーワード(2)(和/英) ヒトiPS由来心筋細胞 / hiPSC-CMs
キーワード(3)(和/英) 品質管理 / Quality Control
キーワード(4)(和/英) 創薬 / Drug Development
第 1 著者 氏名(和/英) 折田 健 / Ken Orita
第 1 著者 所属(和/英) 東京大学(略称:東大)
The University of Tokyo(略称:UTokyo)
第 2 著者 氏名(和/英) 澤田 光平 / Kohei Sawada
第 2 著者 所属(和/英) 東京大学(略称:東大)
The University of Tokyo(略称:UTokyo)
第 3 著者 氏名(和/英) 池谷 裕二 / Yuji Ikegaya
第 3 著者 所属(和/英) 東京大学(略称:東大)
The University of Tokyo(略称:UTokyo)
発表年月日 2019-01-23
資料番号 NC2018-42
巻番号(vol) vol.118
号番号(no) NC-414
ページ範囲 pp.23-23(NC),
ページ数 1
発行日 2019-01-16 (NC)