| 講演名 | 2018-03-13 NGSデータを用いた遺伝子領域内の配列変異の比較による要因遺伝子の抽出法 松井 一馬(工学院大), 梅津 知宏(東京医科大), 大屋敷 純子(東京医科大), 福岡 豊(工学院大), |
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| 抄録(和) | 次世代シーケンサ（NGS）を用いた配列変異の解析では一塩基多型を主に対象とすることが多い。特異的な変化を持つ領域の同定は可能であるが、疾患の要因遺伝子の同定は難しかった。また、一塩基多型のデータは膨大な量になり、解析時間も長くなる。従って、そのような膨大なデータを扱わず、少数で構造変異を解析する方法が求められる。この考えに基づき、本研究では構造的な変異である欠失と挿入を用い遺伝子単位で解析し、得られた遺伝子の発現量を統計的に処理することで疾患に関連する要因遺伝子を抽出する方法を提案する。 |
| 抄録(英) | In this study, a method was proposed for determining differential mutations in next generation sequencing datasets from multiple myeloma cell lines cultured under normal and hypoxic conditions. Many differential mutations were found around tumor suppressor genes, suggesting that those genes play a role in hypoxia tolerance. The obtained gene expression data was statistically processed to extract candidate disease factor genes. These results indicated the usefulness of the proposed method. |
| キーワード(和) | 次世代シーケンサ / 変異解析 / 要因遺伝子 |
| キーワード(英) | Next Generation Sequencer / mutation analysis / factor gene |
| 資料番号 | MBE2017-95 |
| 発行日 | 2018-03-06 (MBE) |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MBE / NC |
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| 開催期間 | 2018/3/13(から2日開催) |
| 開催地（和） | 機械振興会館 |
| 開催地（英） | Kikai-Shinko-Kaikan Bldg. |
| テーマ（和） | ME，一般 |
| テーマ（英） | ME, general |
| 委員長氏名（和） | 中島 一樹(富山大) / 萩原 将文(慶大) |
| 委員長氏名（英） | Kazuki Nakajima(Univ. of Toyama) / Masafumi Hagiwara(Keio Univ.) |
| 副委員長氏名（和） | 京相 雅樹(東京都市大) / 平田 豊(中部大) |
| 副委員長氏名（英） | Masaki Kyoso(TCU) / Yutaka Hirata(Chubu Univ.) |
| 幹事氏名（和） | 高野 博史(富山県立大) / 永岡 隆(近畿大) / 青西 亨(東工大) / 吉川 大弘(名大) |
| 幹事氏名（英） | Hironobu Takano(Toyama Pref. Univ.) / Takashi Nagaoka(Kindai Univ.) / Toru Aonishi(Tokyo Inst. of Tech.) / Tomohiro Yoshikawa(Nagoya Univ.) |
| 幹事補佐氏名（和） | 金 主賢(富山大) / 小林 匠(横国大) / 篠沢 佳久(慶大) / 稲垣 圭一郎(中部大) |
| 幹事補佐氏名（英） | Kim Juhyon(Univ. of Toyama) / Takumi Kobayashi(YNU) / Yoshihisa Shinozawa(Keio Univ.) / Keiichiro Inagaki(Chubu Univ.) |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Technical Committee on ME and Bio Cybernetics / Technical Committee on Neurocomputing |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | NGSデータを用いた遺伝子領域内の配列変異の比較による要因遺伝子の抽出法 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Extraction of Factor Genes by Comparing Sequence Mutations in Gene Regions Based on NGS Data |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 次世代シーケンサ / Next Generation Sequencer |
| キーワード(2)（和/英） | 変異解析 / mutation analysis |
| キーワード(3)（和/英） | 要因遺伝子 / factor gene |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 松井 一馬 / Kazuma Matsui |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 工学院大学(略称：工学院大) Kogakuin University(略称：Kogakuin Univ.) |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 梅津 知宏 / Tomohiro Umezu |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 東京医科大学(略称：東京医科大) Tokyo Medical University(略称：Tokyo Medical Univ.) |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 大屋敷 純子 / Junko H. Ohyashiki |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 東京医科大学(略称：東京医科大) Tokyo Medical University(略称：Tokyo Medical Univ.) |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 福岡 豊 / Yutaka Fukuoka |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 工学院大学(略称：工学院大) Kogakuin University(略称：Kogakuin Univ.) |
| 発表年月日 | 2018-03-13 |
| 資料番号 | MBE2017-95 |
| 巻番号（vol） | vol.117 |
| 号番号（no） | MBE-507 |
| ページ範囲 | pp.79-82(MBE), |
| ページ数 | 4 |
| 発行日 | 2018-03-06 (MBE) |