| 講演名 | 2017-03-14 microRNAと遺伝子の統計的統合解析法の検討 大木 拓也(工学院大), 福岡 豊(工学院大), 梅津 知宏(東京医科大), 大屋敷 純子(東京医科大), |
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| 抄録(和) | non-cording RNAの1種であるmicroRNA（miRNA）は、ターゲット遺伝子の発現を抑制する働きがあるとされている。そのような中で、がんにおける発現を解析するさまざまなmiRNAの研究が増えている。miRNAと遺伝子の統合解析において少数のデータによる解析では、有意な結果が得られないことが多い。本研究では、miRNAと遺伝子の少数の発現データでも統合解析が可能な方法を提案し、miRNAによって大きく変化する機能を検出することを検討した。この方法は、バックグランドとした遺伝子群とmiRNAによって制御される特定の機能を持つ遺伝子群のグループ同士を比較するものである。シミュレーションを行い、提案法の有効性を検証した。シミュレーションの結果、遺伝子の発現量の変化に応じてグループ間の差も大きく変化し、提案法の有効性が示唆された。提案法をがん細胞由来のデータに適用した結果、miRNAによって大きく変化する機能を検出した。その機能はがんと関連があることが示唆された。 |
| 抄録(英) | A microRNA (miRNA), which is a non-cording RNA, regulates genes, and recently its role in cancer attracts attention. Therefore, the number of studies on expression levels of miRNAs in cancer cells is increasing. Results of integrative analyses of miRNAs and mRNAs are largely affected by the size of the data used for the analysis. For a small sized data set, the numbers of significantly altered miRNAs and mRNAs tend to be small, indicating that no meaningful results are obtained. This study proposed a method for such small sized data sets. This method compared target genes of a miRNA as a group with randomly selected genes (back ground genes). We performed simulations to investigate the effectiveness of the proposed method. The simulation results indicated that the statistics used in the proposed method reflected the differences in the simulated data. Then, we applied it to real cancer data. Some groups of genes having functions related to cancer were extracted as significantly altered. These results suggest the effectiveness of the proposed the method. |
| キーワード(和) | microRNA(miRNA) / 遺伝子（mRNA） / 統合解析 / がん |
| キーワード(英) | MicroRNA (MiRNA) / Gene (MRNA) / Integrative Analysis / Cancer |
| 資料番号 | MBE2016-101 |
| 発行日 | 2017-03-06 (MBE) |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MBE / NC |
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| 開催期間 | 2017/3/13(から2日開催) |
| 開催地（和） | 機械振興会館 |
| 開催地（英） | Kikai-Shinko-Kaikan Bldg. |
| テーマ（和） | ME, 一般 |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | 福岡 豊(工学院大) / 佐藤 茂雄(東北大) |
| 委員長氏名（英） | Yutaka Fukuoka(Kogakuin Univ.) / Shigeo Sato(Tohoku Univ.) |
| 副委員長氏名（和） | 中島 一樹(富山大) / 萩原 将文(慶大) |
| 副委員長氏名（英） | Kazuki Nakajima(Univ. of Toyama) / Masafumi Hagiwara(Keio Univ.) |
| 幹事氏名（和） | 田中 久弥(工学院大) / 高野 博史(富山県立大) / 田中 宏喜(京都産大) / 青西 亨(東工大) |
| 幹事氏名（英） | Hisaya Tanaka(Kogakuin Univ.) / Hiroshi Takano(Toyama Pref. Univ.) / Hiroki Tanaka(Kyoto Sangyo Univ.) / Toru Aonishi(Tokyo Inst. of Tech.) |
| 幹事補佐氏名（和） | 堀江 亮太(芝浦工大) / 金 主賢(富山大) / 秋間 学尚(東北大) / 篠沢 佳久(慶大) |
| 幹事補佐氏名（英） | Ryota Horie(Shibaura Inst. of Tech.) / Kim Juhyon(Univ. of Toyama) / Hisanao Akima(Tohoku Univ.) / Yoshihisa Shinozawa(Keio Univ.) |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Technical Committee on ME and Bio Cybernetics / Technical Committee on Neurocomputing |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | microRNAと遺伝子の統計的統合解析法の検討 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Statistical Integrative Analysis of MicroRNA and Gene |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | microRNA(miRNA) / MicroRNA (MiRNA) |
| キーワード(2)（和/英） | 遺伝子（mRNA） / Gene (MRNA) |
| キーワード(3)（和/英） | 統合解析 / Integrative Analysis |
| キーワード(4)（和/英） | がん / Cancer |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 大木 拓也 / Takuya Oki |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 工学院大学(略称：工学院大) Kogakuin University(略称：Kogakuin Univ.) |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 福岡 豊 / Yutaka Fukuoka |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 工学院大学(略称：工学院大) Kogakuin University(略称：Kogakuin Univ.) |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 梅津 知宏 / Tomohiro Umezu |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 東京医科大学(略称：東京医科大) Tokyo Medical University(略称：Tokyo Med Univ.) |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 大屋敷 純子 / Junko Ohyashiki |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 東京医科大学(略称：東京医科大) Tokyo Medical University(略称：Tokyo Med Univ.) |
| 発表年月日 | 2017-03-14 |
| 資料番号 | MBE2016-101 |
| 巻番号（vol） | vol.116 |
| 号番号（no） | MBE-520 |
| ページ範囲 | pp.91-94(MBE), |
| ページ数 | 4 |
| 発行日 | 2017-03-06 (MBE) |