| 講演名 | 2023-07-07 Enhancing Glycan Recognition Pattern Learning with Tree-Structured Data Mining 戸塚 健人(創価大), 篠宮 紀彦(創価大), 木下 聖子(創価大), 細田 正恵(創価大), |
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| 抄録(和) | |
| 抄録(英) | In recent times, the rapid proliferation of semi-structured data has been primarily fueled by the emergence of the World Wide Web and bioinformatics. Notably, tree-structured data has gained prominence as a common format for data storage, and its potential for data mining has garnered significant attention. Glycans, being indispensable biomolecules present in all organisms, are recognized by molecules and play diverse functional roles in the body. They are commonly modeled as tree-structured data and analyzed using machine learning techniques in the domain of glycoinformatics. However, to fully understand the biological properties and functions of glycans, more detailed data is required. To address this research gap, we implemented a novel approach that incorporates information on the binding patterns between monosaccharides, the constituent units of a glycan, into glycan data. The data was subsequently subjected to analysis using the OTMM algorithm, a sophisticated probabilistic model for mining labeled ordered trees. Consequently, this approach enabled the extraction of biologically meaningful structures called motifs in glycans with a high degree of precision and detail, surpassing the results of previous research efforts. This study contributes to a comprehensive understanding of glycan structure recognition mechanisms and their function. The outcome of this study is also expected to enable researchers to conduct experiments on glycans more efficiently and expedite the process of elucidating their essential properties. |
| キーワード(和) | |
| キーワード(英) | machine learningprobabilistic modelgraph theoryglycanglycoinformaticsbioinformatics |
| 資料番号 | CAS2023-20,VLD2023-20,SIP2023-36,MSS2023-20 |
| 発行日 | 2023-06-29 (CAS, VLD, SIP, MSS) |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS / CAS / SIP / VLD |
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| 開催期間 | 2023/7/6(から2日開催) |
| 開催地（和） | 小樽商科大学 3号館 102教室 |
| 開催地（英） | |
| テーマ（和） | システムと信号処理および一般 |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | 山口 真悟(山口大) / 相原 康敏(オムニビジョン) / 仲地 孝之(琉球大) / 中武 繁寿(北九州市大) |
| 委員長氏名（英） | Shingo Yamaguchi(Yamaguchi Univ.) / Yasutoshi Aibara(OmniVision) / Takayuki Nakachi(Ryukyu Univ.) / Shigetoshi Nakatake(Univ. of Kitakyushu) |
| 副委員長氏名（和） | 宮本 俊幸(阪工大) / 篠宮 紀彦(創価大) / 市毛 弘一(横浜国大) / 西川 清史(都立大) / 桜井 祐市(日立) |
| 副委員長氏名（英） | Toshiyuki Miyamoto(Osaka Inst. of Tech.) / Norihiko Shinomiya(Soka Univ.) / Koichi Ichige(Yokohama National Univ.) / Kiyoshi Nishikawa(okyo Metropolitan Univ.) / Yuichi Sakurai(Hitachi) |
| 幹事氏名（和） | 林 直樹(阪大) / 劉 健全(NEC) / 笠松 大佑(創価大) / 鈴木 寛人(ルネサスエレクトロニクス) / 今泉 祥子(千葉大) / 京地 清介(工学院大) / 笹川 幸宏(ソシオネクスト) / 今井 雅(弘前大) |
| 幹事氏名（英） | Naoki Hayashi(Osaka Univ.) / Jianquan Liui(NEC) / Daisuke Kasamatsu(Soka Univ.) / Hiroto Suzuki(Renesas Electronics) / Shoko Imaizumi(Chiba Univ.) / Seisuke Kyochi(Kogakuin Univ.) / Yukihiro Sasagawa(Socionext) / Masashi Imai(Hirosaki Univ.) |
| 幹事補佐氏名（和） | 白井 匡人(島根大) / 伊藤 尚(富山高専) / 山口 基(テクノプロ) / 下田 真二(ソニーセミコンダクタソリューションズ) / 越田 俊介(八戸工大) / 吉田 太一(電通大) / 塩田 さやか(都立大) / 西元 琢真(日立) |
| 幹事補佐氏名（英） | Masato Shirai(Shimane Univ.) / Nao Ito(NIT, Toyama college) / Motoi Yamaguchi(TECHNOPRO) / Shinji Shimoda(Sony Semiconductor Solutions) / Shunsuke Koshita(Hachinohe Inst. of Tech.) / Taichi Yoshida(UEC) / Sayaka Shiota(Tokyo Metropolitan Univ.) / Takuma Nishimoto(Hitachi) |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Technical Committee on Mathematical Systems Science and its Applications / Technical Committee on Circuits and Systems / Technical Committee on Signal Processing / Technical Committee on VLSI Design Technologies |
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| 本文の言語 | ENG |
| タイトル（和） | |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Enhancing Glycan Recognition Pattern Learning with Tree-Structured Data Mining |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | / machine learningprobabilistic modelgraph theoryglycanglycoinformaticsbioinformatics |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 戸塚 健人 / Kento Totsuka |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 創価大学(略称：創価大) Soka University(略称：Soka Univ.) |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 篠宮 紀彦 / Norihiko Shinomiya |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 創価大学(略称：創価大) Soka University(略称：Soka Univ.) |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 木下 聖子 / Kiyoko Kinoshita |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 創価大学(略称：創価大) Soka University(略称：Soka Univ.) |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 細田 正恵 / Masae Hosoda |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 創価大学(略称：創価大) Soka University(略称：Soka Univ.) |
| 発表年月日 | 2023-07-07 |
| 資料番号 | CAS2023-20,VLD2023-20,SIP2023-36,MSS2023-20 |
| 巻番号（vol） | vol.123 |
| 号番号（no） | CAS-97,VLD-98,SIP-99,MSS-100 |
| ページ範囲 | pp.97-101(CAS), pp.97-101(VLD), pp.97-101(SIP), pp.97-101(MSS), |
| ページ数 | 5 |
| 発行日 | 2023-06-29 (CAS, VLD, SIP, MSS) |