| 講演名 | 2022-01-28 CNNとスペクトラルクラスタリングを用いたボトムアップ指向の染色体異常識別 高見 燎世(阪大), 槇原 靖(阪大), 八木 康史(阪大), 川端 絵美(広島大), 衣笠 泰葉(広島大), 田代 聡(広島大), |
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| 抄録(和) | 本研究では，染色体の蛍光顕微鏡画像から染色体の要素をボトムアップに検出することで，染色体異常を識別する手法を提案する．染色体は，主にセントロメア・テロメアとそれらを接続するDNAの三つの要素から構成される．まず，畳み込みニューラルネットワーク(Convolutional neural network: CNN)を用いて，セントロメア・テロメアの尤度マップを出力し，そのピークをセントロメア・テロメアの位置とする．また，DNAについては，接続方向の情報を含めた尤度マップをCNNにより出力し，セントロメア・テロメア間を接続するDNAのスコア（信頼度）を計算する．更に，DNAの接続スコアを元に，セントロメア・テロメアの接続を表すグラフの重み付き隣接行列を計算し，スペクトラルクラスタリングにより個別の染色体へ分割する．その際，クラスタリングによる過分割や分割漏れを訂正するため，染色体の形状に基づいた評価関数を定義した上で，再分割や併合処理を適用する．最後に，個々に分割された染色体のグラフ構造を元に，染色体異常を識別する．実験では，21枚の染色体画像を用いて精度評価を行い，結果として，染色体異常識別の精度は90.3%となった． |
| 抄録(英) | |
| キーワード(和) | 染色体 / ボトムアップ手法 / CNN / スペクトラルクラスタリング / 蛍光顕微鏡画像 |
| キーワード(英) | |
| 資料番号 | MVE2021-38 |
| 発行日 | 2022-01-20 (MVE) |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | MVE / IPSJ-CVIM / VRSJ-SIG-MR |
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| 開催期間 | 2022/1/27(から2日開催) |
| 開催地（和） | オンライン開催 |
| 開催地（英） | Online |
| テーマ（和） | 多様なカメラを用いたメディア処理 |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | 井原 雅行(理研) |
| 委員長氏名（英） | Masayuki Ihara(RIKEN) |
| 副委員長氏名（和） | 清川 清(奈良先端大) |
| 副委員長氏名（英） | Kiyoshi Kiyokawa(NAIST) |
| 幹事氏名（和） | 西口 敏司(阪工大) / 横山 正典(NTT) / 福嶋 政期(東大) |
| 幹事氏名（英） | Satoshi Nishiguchi(Oosaka Inst. of Tech.) / Masanori Yokoyama(NTT) / Shogo Fukushima(Univ. of ToKyo) |
| 幹事補佐氏名（和） | 磯山 直也(奈良先端大) / 原 豪紀(大日本印刷) / 後藤 充裕(NTT) |
| 幹事補佐氏名（英） | Naoya Isoyama(NAIST) / Takenori Hara(DNP) / Mitsuhiro Goto(NTT) |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Technical Committee on Media Experience and Virtual Environment / Special Interest Group on Computer Vision and Image Media / SIG-MR |
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| 本文の言語 | JPN-ONLY |
| タイトル（和） | CNNとスペクトラルクラスタリングを用いたボトムアップ指向の染色体異常識別 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 染色体 |
| キーワード(2)（和/英） | ボトムアップ手法 |
| キーワード(3)（和/英） | CNN |
| キーワード(4)（和/英） | スペクトラルクラスタリング |
| キーワード(5)（和/英） | 蛍光顕微鏡画像 |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 高見 燎世 / Ryosei Takami |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 大阪大学(略称：阪大) Osaka University(略称：Osaka Univ.) |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 槇原 靖 / Yasushi Makihara |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 大阪大学(略称：阪大) Osaka University(略称：Osaka Univ.) |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 八木 康史 / Yasushi Yagi |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 大阪大学(略称：阪大) Osaka University(略称：Osaka Univ.) |
| 第 4 著者 氏名（和/英） | 川端 絵美 / Emi Kawabata |
| 第 4 著者 所属（和/英） | 広島大学(略称：広島大) Hiroshima University(略称：Hiroshima Univ.) |
| 第 5 著者 氏名（和/英） | 衣笠 泰葉 / yasuha kinugasa |
| 第 5 著者 所属（和/英） | 広島大学(略称：広島大) Hiroshima University(略称：Hiroshima Univ.) |
| 第 6 著者 氏名（和/英） | 田代 聡 / Satoshi Tashiro |
| 第 6 著者 所属（和/英） | 広島大学(略称：広島大) Hiroshima University(略称：Hiroshima Univ.) |
| 発表年月日 | 2022-01-28 |
| 資料番号 | MVE2021-38 |
| 巻番号（vol） | vol.121 |
| 号番号（no） | MVE-349 |
| ページ範囲 | pp.49-54(MVE), |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2022-01-20 (MVE) |