| 講演名 | 2021-12-01 拡張ネットワークフローモデルの最適な階層数を求める手法 石田 滉(立命館大), 山下 茂(立命館大), |
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| 抄録(和) | 試薬合成は DMFB の生化学実験で必要な工程である. 試薬合成手法には NFM という手法が存在する. NFM は, 1 つの濃度値のみを生成する場合に最適な解を求めることができる. しかし, 複数の濃度値を生成する場合は, XNFM という手法が存在する. XNFM は, NFM のネットワークフローに階層を追加するが, 最適な解を求めるための最小数は 不明である. この論文では, XNFM の最適な階層数を求める手法を提案する. この手法は全探索で行うため, 計算に時間 がかかる. また, XNFM に必要な階層数を見つけるためのヒューリスティックを提案する. ヒューリスティックは, 全探 索より計算時間が最大99%短縮できることを確認した. |
| 抄録(英) | Sample preparation is an indispensable process when we perform biochemical experiments on DMFBs. There exists an optimal sample preparation method called NFM. NFM is indeed optimal when we generate only one concentration value. However, when we need to generate more than one concentration values, there is a better method called XNFM; XNFM adds extra layers to network flows of NFM to get better results. However, it is not known how many layers should be added to NFM to get optimal results. Thus, this paper proposes a method to find the minimum number of additional layers for XNFM to get optimal results. Because the method is based on an exhaustive search, it is time-consuming; we also propose a heuristic to find the necessary number of layers for XNFM. We show that our heuristics reduce the computation time of the exhaustive search by up to 99%. |
| キーワード(和) | バイオチップ / 試薬合成 / ネットワークフロー |
| キーワード(英) | Biochip / Sample Preparation / Network-Flow |
| 資料番号 | VLD2021-29,ICD2021-39,DC2021-35,RECONF2021-37 |
| 発行日 | 2021-11-24 (VLD, ICD, DC, RECONF) |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | VLD / DC / RECONF / ICD / IPSJ-SLDM |
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| 開催期間 | 2021/12/1(から2日開催) |
| 開催地（和） | オンライン開催 |
| 開催地（英） | Online |
| テーマ（和） | デザインガイア2021 -VLSI設計の新しい大地- |
| テーマ（英） | Design Gaia 2021 -New Field of VLSI Design- |
| 委員長氏名（和） | 小林 和淑(京都工繊大) / 高橋 寛(愛媛大) / 佐野 健太郎(理研) / 高橋 真史(キオクシア) / 中村 祐一(NEC) |
| 委員長氏名（英） | Kazutoshi Kobayashi(Kyoto Inst. of Tech.) / Hiroshi Takahashi(Ehime Univ.) / Kentaro Sano(RIKEN) / Masafumi Takahashi(Kioxia) / Yuichi Nakamura(NEC) |
| 副委員長氏名（和） | 池田 奈美子(NTT) / 土屋 達弘(阪大) / 山口 佳樹(筑波大) / 泉 知論(立命館大) / 池田 誠(東大) |
| 副委員長氏名（英） | Minako Ikeda(NTT) / Tatsuhiro Tsuchiya(Osaka Univ.) / Yoshiki Yamaguchi(Tsukuba Univ.) / Tomonori Izumi(Ritsumeikan Univ.) / Makoto Ikeda(Univ. of Tokyo) |
| 幹事氏名（和） | 兼本 大輔(大阪大学) / 宮村 信(NEC) / 新井 雅之(日大) / 難波 一輝(千葉大) / 小林 悠記(NEC) / 中原 啓貴(東工大) / 廣瀬 哲也(阪大) / 新居 浩二(TSMCデザインテクノロジージャパン) / 瀬戸 謙修(東京都市大) / 川村 一志(東工大) / 廣本 正之(富士通) / 細田 浩希(ソニーLSIデザイン) |
| 幹事氏名（英） | Daisuke Kanemoto(Osaka Univ.) / Makoto Miyamura(NEC) / Masayuki Arai(Nihon Univ.) / Kazuteru Namba(Chiba Univ.) / Yuuki Kobayashi(NEC) / Hiroki Nakahara(Tokyo Inst. of Tech.) / Tetsuya Hirose(Osaka Univ.) / Koji Nii(TSMC) / Kenshu Seto(Tokyo City Univ.) / Kazushi Kawamura(Tokyo Inst. of Tech.) / Masayuki Hiromoto(Fujitsu) / Hiroki Hosoda(Sony LSI Design) |
| 幹事補佐氏名（和） | / / 竹村 幸尚(インテル) / 長名 保範(琉球大学) / 宮地 幸祐(信州大) / 吉原 義昭(キオクシア) / 久保木 猛(九大) |
| 幹事補佐氏名（英） | / / Yukitaka Takemura(INTEL) / Yasunori Osana(Ryukyu Univ.) / Kosuke Miyaji(Shinshu Univ.) / Yoshiaki Yoshihara(キオクシア) / Takeshi Kuboki(Kyushu Univ.) |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Technical Committee on VLSI Design Technologies / Technical Committee on Dependable Computing / Technical Committee on Reconfigurable Systems / Technical Committee on Integrated Circuits and Devices / Special Interest Group on System and LSI Design Methodology |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 拡張ネットワークフローモデルの最適な階層数を求める手法 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Determining Optimal Number of Layers for Network-Flow-based Sample Preparation |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | バイオチップ / Biochip |
| キーワード(2)（和/英） | 試薬合成 / Sample Preparation |
| キーワード(3)（和/英） | ネットワークフロー / Network-Flow |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 石田 滉 / Akira Ishida |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 立命館大学(略称：立命館大) Ritsumeikan University(略称：Ritsumeikan Univ.) |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 山下 茂 / Shigeru Yamashita |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 立命館大学(略称：立命館大) Ritsumeikan University(略称：Ritsumeikan Univ.) |
| 発表年月日 | 2021-12-01 |
| 資料番号 | VLD2021-29,ICD2021-39,DC2021-35,RECONF2021-37 |
| 巻番号（vol） | vol.121 |
| 号番号（no） | VLD-277,ICD-278,DC-279,RECONF-280 |
| ページ範囲 | pp.72-77(VLD), pp.72-77(ICD), pp.72-77(DC), pp.72-77(RECONF), |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2021-11-24 (VLD, ICD, DC, RECONF) |