| 講演名 | 2019-08-02 細菌叢データから相互作用ネットワークを推定する手法の活用 中岡 慎治(北大), 鈴木 憲幸(青学大), 竹内 康博(青学大), |
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| 抄録(和) | 近年、DNA 塩基配列から特定する計測技術が普及したことにより、土壌や腸内に存在する細菌群集を計測できるようになった。微生物群集の塩基配列データを解析することで、たとえば腸炎など疾患発症時の腸内細菌叢の状態変化を可視化することができる。一方、データから細菌ネットワークを推定する試みは現在も活発な研究対象である。本研究では、細菌群集データから相互作用ネットワークを推定する手法について考察する。 |
| 抄録(英) | DNA sequence technology is indispensable for identifying a living organism as a set of genes. Metagenomic sequencing simultaneously targets several different microbial species to identify existing microbial species in a given environment. Informatics analysis of metagenomic datasets opens an opportunity to track a disease progression such as inflammatory bowel disease via compositional change of a gut microbial community. Although species composition can be easily identified from metagenomic data via visualization, more elaboration is required to infer associations among microbial species that constitute and maintain a community. In this talk, I would like to introduce research progress on inferring an interaction network in a microbial community from metagenomic datasets. |
| キーワード(和) | 細菌叢 / 塩基配列解析 / ネットワーク推定 |
| キーワード(英) | microbiota / DNA sequencing / network inference |
| 資料番号 | CCS2019-22 |
| 発行日 | 2019-07-25 (CCS) |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | CCS / IN |
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| 開催期間 | 2019/8/1(から2日開催) |
| 開催地（和） | KIKI 知床 ナチュラルリゾート |
| 開催地（英） | KIKI SHIRETOKO NATURAL RESORT |
| テーマ（和） | ネットワークの科学、将来ネットワーク 、クラウド/SDN/仮想化、コンテンツ配信・流通、及び一般 |
| テーマ（英） | |
| 委員長氏名（和） | 成瀬 誠(NICT) / 岸田 卓治(NTT-AT) |
| 委員長氏名（英） | Makoto Naruse(NICT) / Takuji Kishida(NTT-AT) |
| 副委員長氏名（和） | 塩川 茂樹(神奈川工科大) / 浅井 哲也(北大) / 石田 賢治(広島市大) |
| 副委員長氏名（英） | Shigeki Shiokawa(Kanagawa Inst. of Tech.) / Tetsuya Asai(Hokkaido Univ.) / Kenji Ishida(Hiroshima City Univ.) |
| 幹事氏名（和） | 高野 知佐(広島市立大) / 川喜田 佑介(神奈川工科大) / 加島 伸悟(NTTコミュニケーションズ) / 持田 誠一郎(NTT) / 小畑 博靖(広島市大) / 樫原 俊太郎(KDDI総合研究所) |
| 幹事氏名（英） | Chisa Takano(Hiroshima City Univ.) / Yusuke Kawakita(Kanagawa Inst. of Tech.) / Shingo Kashima(NTT Communications) / Seiichiro Mochida(NTT) / Hiroyasu Obata(Hiroshima City Univ.) / Shuntaro Kashihara(KDDI Research) |
| 幹事補佐氏名（和） | 中野 秀洋(東京都市大) / 中田 一紀(筑波技大) / 安東 弘泰(筑波大) / 松原 崇(神戸大) |
| 幹事補佐氏名（英） | Hidehiro Nakano(Tokyo City Univ.) / Kazuki Nakada(Tsukuba Univ. of Tech.) / Hiroyasu Ando(Tsukuba Univ.) / Takashi Matsubara(Kobe Univ.) |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Technical Committee on Complex Communication Sciences / Technical Committee on Information Networks |
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| 本文の言語 | JPN |
| タイトル（和） | 細菌叢データから相互作用ネットワークを推定する手法の活用 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A computational method to infer microbial interaction network |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 細菌叢 / microbiota |
| キーワード(2)（和/英） | 塩基配列解析 / DNA sequencing |
| キーワード(3)（和/英） | ネットワーク推定 / network inference |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 中岡 慎治 / Shinji Nakaoka |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 北海道大学(略称：北大) Hokkaido University(略称：Hokudai) |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 鈴木 憲幸 / Suzuki |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 青山学院大学(略称：青学大) Aoyamagakuin University(略称：Aogaku Univ.) |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | 竹内 康博 / Takeuchi |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 青山学院大学(略称：青学大) Aoyamagakuin University(略称：Aogaku Univ.) |
| 発表年月日 | 2019-08-02 |
| 資料番号 | CCS2019-22 |
| 巻番号（vol） | vol.119 |
| 号番号（no） | CCS-157 |
| ページ範囲 | pp.23-25(CCS), |
| ページ数 | 3 |
| 発行日 | 2019-07-25 (CCS) |