| 講演名 | 2019-03-15 遺伝子制御ネットワークの構造と機能について：（Ahnert and Fink 2016）の再分析 原田 陽美(山口大), 松野 浩嗣(山口大), アドリエン フォレ(山口大), |
|---|---|
| PDFダウンロードページ |  PDFダウンロードページへ |
| 抄録(和) | ブーリアンネットワークによるネットワークモチーフの研究はその構造と機能の関係に焦点が当てられてきた．これまでいくつかの先行研究があるが，これらでは機能について異なる定義がなされており，異なる結論が導き出される．本研究ではトーマス予想に基づきエッジと閉路の機能に着目して，モチーフのトポロジーとサイクルの種類数とベーシンエントロピーの２つの尺度の結び付きについて再分析を行った．結果としてモチーフ内のエッジの本数とベーシンエントロピーの相関は，過去に示された結果より低いことが得られた． |
| 抄録(英) | Research on network motifs has recently focused on the relationship between form and function, in the context of Boolean networks. For lack of a common definition of "function" however, different groups tend to reach opposite conclusions. Here we rely on the well-established notions of edge and circuit functionality, as defined in the wake of Thomas' conjectures, to revisit the link between the topology of a motif and two previously studied measures, basin entropy and cycle length diversity. Our results suggest that the correlation between the number of edges in a motif and basin entropy is weaker than previously though. |
| キーワード(和) | 遺伝子制御ネットワーク / ブーリアンモデル / ネットワークモチーフ / フィードフォワードループ / フィードバックループ |
| キーワード(英) | gene regulatory networks / Boolean model / network motif / feed-forward loop / feedback loop |
| 資料番号 | MSS2018-93 |
| 発行日 | 2019-03-07 (MSS) |
| 研究会情報 | |
| 研究会 | NLP / MSS |
|---|---|
| 開催期間 | 2019/3/14(から2日開催) |
| 開催地（和） | 福井大学 文京キャンパス |
| 開催地（英） | Bunkyo Camp., Univ. of Fukui |
| テーマ（和） | SICE-DES研究会，IEICE-MSS研究会，IEICE-NLP研究会の3研究会併催，一般およびWork In Progress(WIP) |
| テーマ（英） | SICE-DES, IEICE-MSS, IEICE-NLP, Work In Progress, and etc. |
| 委員長氏名（和） | 高橋 規一(岡山大) / 名嘉村 盛和(琉球大) |
| 委員長氏名（英） | Norikazu Takahashi(Okayama Univ.) / Morikazu Nakamura(Univ. of Ryukyus) |
| 副委員長氏名（和） | 黒川 弘章(東京工科大) / 髙井 重昌(阪大) |
| 副委員長氏名（英） | Hiroaki Kurokawa(Tokyo Univ. of Tech.) / Shigemasa Takai(Osaka Univ.) |
| 幹事氏名（和） | 山内 将行(広島工大) / 木村 貴幸(日本工大) / 豊嶋 伊知郎(東芝エネルギーシステムズ) / 金澤 尚史(阪大) |
| 幹事氏名（英） | Masayuki Yamauchi(Hiroshima Inst. of Tech.) / Takayuki Kimura(Nippon Inst. of Tech.) / Ichiro Toyoshima(Toshiba) / Takahumi Kanazawa(Osaka Univ.) |
| 幹事補佐氏名（和） | 木村 真之(京大) / 島田 裕(埼玉大) / 金城 秀樹(沖縄大) |
| 幹事補佐氏名（英） | Masayuki Kimura(Kyoto Univ.) / Yutaka Shimada(Saitama Univ.) / Hideki Kinjo(Okinawa Univ.) |
| 講演論文情報詳細 | |
| 申込み研究会 | Technical Committee on Nonlinear Problems / Technical Committee on Mathematical Systems Science and its applications |
|---|---|
| 本文の言語 | ENG-JTITLE |
| タイトル（和） | 遺伝子制御ネットワークの構造と機能について：（Ahnert and Fink 2016）の再分析 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Form and function in gene regulatory networks: revisiting Ahnert and Fink, 2016 |
| サブタイトル（和） | |
| キーワード(1)（和/英） | 遺伝子制御ネットワーク / gene regulatory networks |
| キーワード(2)（和/英） | ブーリアンモデル / Boolean model |
| キーワード(3)（和/英） | ネットワークモチーフ / network motif |
| キーワード(4)（和/英） | フィードフォワードループ / feed-forward loop |
| キーワード(5)（和/英） | フィードバックループ / feedback loop |
| 第 1 著者 氏名（和/英） | 原田 陽美 / Minami Harada |
| 第 1 著者 所属（和/英） | 山口大学(略称：山口大) Yamaguchi University(略称：Yamaguchi Univ.) |
| 第 2 著者 氏名（和/英） | 松野 浩嗣 / Hiroshi Matsuno |
| 第 2 著者 所属（和/英） | 山口大学(略称：山口大) Yamaguchi University(略称：Yamaguchi Univ.) |
| 第 3 著者 氏名（和/英） | アドリエン フォレ / Adrien Faure |
| 第 3 著者 所属（和/英） | 山口大学(略称：山口大) Yamaguchi University(略称：Yamaguchi Univ.) |
| 発表年月日 | 2019-03-15 |
| 資料番号 | MSS2018-93 |
| 巻番号（vol） | vol.118 |
| 号番号（no） | MSS-499 |
| ページ範囲 | pp.65-68(MSS), |
| ページ数 | 4 |
| 発行日 | 2019-03-07 (MSS) |