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研究会 発表日時 開催地 タイトル・著者 抄録 資料番号
RECONF 2008-05-23
14:25
福島 会津大学 FPGAを用いた生化学シミュレータにおける入力ポート制約を考慮した演算パイプラインスケジューリング
石森智也山田英樹柴田裕一郎長崎大)・長名保範吉見真聡西川由理小嶋利紀天野英晴舟橋 啓慶大)・広井賀子EMBL-EBI)・小栗 清長崎大RECONF2008-20
 [more] RECONF2008-20
pp.113-118
VLD, DC, IPSJ-SLDM
(共催)
CPSY, RECONF, IPSJ-ARC
(併催) [詳細]
2007-11-22
13:25
福岡 北九州国際会議場 高速アルゴリズムを適用したデータ駆動型確率モデル生化学シミュレータのFPGAへの実装と評価
吉見真聡西川由理小嶋利紀長名保範舟橋 啓慶大)・広井賀子EMBL-EBI)・柴田裕一郎山田英樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大RECONF2007-50
本研究報告では,確率モデル生化学シミュレーションアルゴリズムNext Reaction MethodをFPGAを用いて高... [more] RECONF2007-50
pp.43-48
RECONF 2007-09-21
14:00
滋賀 立命館大学びわこくさつキャンパス (滋賀) FPGAを用いたオンチップネットワーク型\\確率モデル生化学シミュレータの提案と評価
吉見真聡西川由理小嶋利紀長名保範舟橋 啓慶大)・広井賀子EMBL-EBI)・柴田裕一郎山田英樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大
(事前公開アブストラクト) 確率モデルによる生化学シミュレーションは離散的な反応系を厳密に取り扱うことができる一方,シミ... [more]
RECONF 2007-05-17
14:00
石川 金沢市文化ホール 生化学シミュレータReCSiPにおける反応速度式共有化
山田英樹岩永直樹柴田裕一郎長崎大)・長名保範吉見真聡岩岡 洋西川由理小嶋利紀天野英晴舟橋 啓慶大)・広井賀子EMBL-EBI)・北野宏明JST)・小栗 清長崎大RECONF2007-3
FPGAをベースとした生化学シミュレータで大きな系のシミュレーションを行う際には、ハードウェア量の削減を行うことが重要と... [more] RECONF2007-3
pp.13-18
RECONF 2006-05-18
17:30
宮城 東北大学 ReCSiPボードにおける汎用ホストインターフェイスの実装と評価
小嶋利紀長名保範吉見真聡岩岡 洋西川由理慶大)・舟橋 啓広井賀子JST)・柴田裕一郎岩永直樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大
 [more] RECONF2006-10
pp.55-60
RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM
(共催)
2006-01-18
14:55
神奈川 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 データ転送網を用いた確率モデル生化学シミュレータのFPGA への実装の検討
吉見真聡長名保範岩岡 洋西川由理小嶋利紀慶大)・舟橋 啓広井賀子JST)・柴田裕一郎岩永直樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大
確率モデル生化学シミュレーションアルゴリズム(SSA)は,生化学システムの厳密なシミュレーションが可能である一方,膨大な... [more] VLD2005-105 CPSY2005-61 RECONF2005-94
pp.47-52
RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM
(共催)
2006-01-18
15:20
神奈川 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPにおける数値積分機構の性能改善手法
西川由理長名保範吉見真聡岩岡 洋小嶋利紀慶大)・舟橋 啓広井賀子JST)・柴田裕一郎岩永直樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大
近年のバイオインフォマティクスにおいて、計算機上での生化学シミュレーションは、細胞内の生化学反応を解析する非常に有効な方... [more] VLD2005-106 CPSY2005-62 RECONF2005-95
pp.53-58
RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM
(共催)
2006-01-18
15:45
神奈川 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPにおけるハードウェアリソース消費に関する考察
長名保範慶大)・岩永直樹長崎大)・吉見真聡岩岡 洋小嶋利紀西川由理慶大)・舟橋 啓JST)・広井賀子慶大)・柴田裕一郎北野宏明長崎大)・天野英晴慶大
(事前公開アブストラクト) FPGA を用いて生化学シミュレーションを行う ReCSiP における、FPGA 上の各種リ... [more] VLD2005-107 CPSY2005-63 RECONF2005-96
pp.59-64
RECONF 2005-09-15
16:15
広島 国民宿舎 みやじま 杜の宿 FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPのシミュレーション制御機構
長名保範吉見真聡岩岡 洋小嶋利紀西川由理慶大)・舟橋 啓広井賀子JST)・柴田裕一郎岩永直樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大
 [more] RECONF2005-39
pp.55-60
RECONF 2005-09-15
16:45
広島 国民宿舎 みやじま 杜の宿 FPGAを用いた生化学シミュレータ向けSBML処理系の構築
岩岡 洋長名保範吉見真聡小嶋利紀西川由理慶大)・舟橋 啓広井賀子JST)・柴田裕一郎岩永直樹長崎大)・北野宏明JST)・天野英晴慶大
計算機を利用した生化学反応のシミュレーションが行なわれるようになってき
た。大規模なシミュレーションモデルを扱う場合、... [more]
RECONF2005-40
pp.61-66
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