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| 研究会 | 発表日時 | 開催地 | タイトル・著者 | 抄録 | 資料番号 | |
| RECONF | 2008-05-23 14:25 |
福島 | 会津大学 | FPGAを用いた生化学シミュレータにおける入力ポート制約を考慮した演算パイプラインスケジューリング ○石森智也・山田英樹・柴田裕一郎（長崎大）・長名保範・吉見真聡・西川由理・小嶋利紀・天野英晴・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・小栗 清（長崎大）  RECONF2008-20 |
[more] | RECONF2008-20 pp.113-118 |
| VLD, DC, IPSJ-SLDM (共催) CPSY, RECONF, IPSJ-ARC (併催) [詳細] |
2007-11-22 13:25 |
福岡 | 北九州国際会議場 | 高速アルゴリズムを適用したデータ駆動型確率モデル生化学シミュレータのFPGAへの実装と評価 ○吉見真聡・西川由理・小嶋利紀・長名保範・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・柴田裕一郎・山田英樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） RECONF2007-50 |
本研究報告では，確率モデル生化学シミュレーションアルゴリズムNext Reaction MethodをFPGAを用いて高... [more] | RECONF2007-50 pp.43-48 |
| RECONF | 2007-09-21 14:00 |
滋賀 | 立命館大学びわこくさつキャンパス （滋賀） | FPGAを用いたオンチップネットワーク型\\確率モデル生化学シミュレータの提案と評価 ○吉見真聡・西川由理・小嶋利紀・長名保範・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・柴田裕一郎・山田英樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
(事前公開アブストラクト) 確率モデルによる生化学シミュレーションは離散的な反応系を厳密に取り扱うことができる一方，シミ... [more] | |
| RECONF | 2007-05-17 14:00 |
石川 | 金沢市文化ホール | 生化学シミュレータReCSiPにおける反応速度式共有化 ○山田英樹・岩永直樹・柴田裕一郎（長崎大）・長名保範・吉見真聡・岩岡 洋・西川由理・小嶋利紀・天野英晴・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・北野宏明（JST）・小栗 清（長崎大） RECONF2007-3 |
FPGAをベースとした生化学シミュレータで大きな系のシミュレーションを行う際には、ハードウェア量の削減を行うことが重要と... [more] | RECONF2007-3 pp.13-18 |
| RECONF | 2006-05-18 17:30 |
宮城 | 東北大学 | ReCSiPボードにおける汎用ホストインターフェイスの実装と評価 ○小嶋利紀・長名保範・吉見真聡・岩岡 洋・西川由理（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
[more] | RECONF2006-10 pp.55-60 |
| RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM (共催) |
2006-01-18 14:55 |
神奈川 | 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 | データ転送網を用いた確率モデル生化学シミュレータのFPGA への実装の検討 ○吉見真聡・長名保範・岩岡 洋・西川由理・小嶋利紀（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
確率モデル生化学シミュレーションアルゴリズム(SSA)は，生化学システムの厳密なシミュレーションが可能である一方，膨大な... [more] | VLD2005-105 CPSY2005-61 RECONF2005-94 pp.47-52 |
| RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM (共催) |
2006-01-18 15:20 |
神奈川 | 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 | FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPにおける数値積分機構の性能改善手法 ○西川由理・長名保範・吉見真聡・岩岡 洋・小嶋利紀（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
近年のバイオインフォマティクスにおいて、計算機上での生化学シミュレーションは、細胞内の生化学反応を解析する非常に有効な方... [more] | VLD2005-106 CPSY2005-62 RECONF2005-95 pp.53-58 |
| RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM (共催) |
2006-01-18 15:45 |
神奈川 | 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 | FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPにおけるハードウェアリソース消費に関する考察 ○長名保範（慶大）・岩永直樹（長崎大）・吉見真聡・岩岡 洋・小嶋利紀・西川由理（慶大）・舟橋 啓（JST）・広井賀子（慶大）・柴田裕一郎・北野宏明（長崎大）・天野英晴（慶大） |
(事前公開アブストラクト) FPGA を用いて生化学シミュレーションを行う ReCSiP における、FPGA 上の各種リ... [more] | VLD2005-107 CPSY2005-63 RECONF2005-96 pp.59-64 |
| RECONF | 2005-09-15 16:15 |
広島 | 国民宿舎 みやじま 杜の宿 | FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPのシミュレーション制御機構 ○長名保範・吉見真聡・岩岡 洋・小嶋利紀・西川由理（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
[more] | RECONF2005-39 pp.55-60 |
| RECONF | 2005-09-15 16:45 |
広島 | 国民宿舎 みやじま 杜の宿 | FPGAを用いた生化学シミュレータ向けSBML処理系の構築 ○岩岡 洋・長名保範・吉見真聡・小嶋利紀・西川由理（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
計算機を利用した生化学反応のシミュレーションが行なわれるようになってき た。大規模なシミュレーションモデルを扱う場合、... [more] |
RECONF2005-40 pp.61-66 |
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