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| 研究会 | 発表日時 | 開催地 | タイトル・著者 | 抄録 | 資料番号 | |
| MI | 2015-03-02 09:05 |
沖縄 | 石垣島 ホテルミヤヒラ | 3D蛍光顕微鏡画像からの哺乳類着床前胚の発生動態の再構成 ○小林徹也（東大）・尾関光徳（慶大）・山縣一夫（阪大）・舟橋 啓（慶大）  MI2014-53 |
哺乳類着床前胚の発生過程に関する情報を経時的な顕微鏡観察画像から得ることは，近年基礎生物学のみならず生殖補助医療などでも... [more] | MI2014-53 pp.1-6 |
| VLD, DC, IPSJ-SLDM (連催) ICD, CPM (共催) CPSY, RECONF (併催) [詳細] |
2011-11-29 09:50 |
宮崎 | ニューウェルシティ宮崎 | FPGAを用いたアクセラレーションシステムにおけるデータパス分類用優良類似度の考察 ○小川ゆい（長崎大）・長名保範（琉球大）・吉見真聡（同志社大）・舟橋 啓・広井賀子・天野英晴（慶大）・柴田裕一郎・小栗 清（長崎大） RECONF2011-46 |
[more] | RECONF2011-46 pp.31-36 |
| RECONF | 2010-05-13 16:45 |
長崎 | 長崎温泉 やすらぎ伊王島 (長崎市伊王島町) | FPGAにおける演算パイプライン共有化のためのデータパス分類手法の提案 ○小川ゆい・大屋智範（長崎大）・長名保範（成蹊大）・吉見真聡（同志社大）・西川由理・舟橋 啓・広井賀子・天野英晴（慶大）・柴田裕一郎・小栗 清（長崎大） RECONF2010-8 |
[more] | RECONF2010-8 pp.43-48 |
| RECONF | 2009-05-14 16:10 |
福井 | 福井大学文京キャンパス | FPGAを用いた汎用生化学シミュレータにおけるハードウェアモジュール自動生成アルゴリズムの実機評価 ○大屋智範・山田英樹・石森智也・柴田裕一郎（長崎大）・長名保範（成蹊大）・吉見真聡（同志社大）・西川由理・天野英晴・舟橋 啓・広井賀子（慶大）・小栗 清（長崎大） RECONF2009-7 |
FPGAをベースとした再構成可能なコンピュータには、性能とハードウェアコスト のトレードオフにおいて、これらの比重を変... [more] |
RECONF2009-7 pp.37-42 |
| RECONF | 2008-09-25 14:30 |
岡山 | 岡山大学 | FPGAを用いた生化学シミュレータにおける反応速度式の類似性に着目した演算パイプライン自動結合アルゴリズム ○山田英樹・石森智也・柴田裕一郎（長崎大）・長名保範・吉見真聡・西川由理・天野英晴・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・小栗 清（長崎大） RECONF2008-26 |
[more] | RECONF2008-26 pp.21-26 |
| RECONF | 2008-05-23 14:25 |
福島 | 会津大学 | FPGAを用いた生化学シミュレータにおける入力ポート制約を考慮した演算パイプラインスケジューリング ○石森智也・山田英樹・柴田裕一郎（長崎大）・長名保範・吉見真聡・西川由理・小嶋利紀・天野英晴・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・小栗 清（長崎大） RECONF2008-20 |
[more] | RECONF2008-20 pp.113-118 |
| VLD, DC, IPSJ-SLDM (共催) CPSY, RECONF, IPSJ-ARC (併催) [詳細] |
2007-11-22 13:25 |
福岡 | 北九州国際会議場 | 高速アルゴリズムを適用したデータ駆動型確率モデル生化学シミュレータのFPGAへの実装と評価 ○吉見真聡・西川由理・小嶋利紀・長名保範・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・柴田裕一郎・山田英樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） RECONF2007-50 |
本研究報告では，確率モデル生化学シミュレーションアルゴリズムNext Reaction MethodをFPGAを用いて高... [more] | RECONF2007-50 pp.43-48 |
| RECONF | 2007-09-21 14:00 |
滋賀 | 立命館大学びわこくさつキャンパス （滋賀） | FPGAを用いたオンチップネットワーク型\\確率モデル生化学シミュレータの提案と評価 ○吉見真聡・西川由理・小嶋利紀・長名保範・舟橋 啓（慶大）・広井賀子（EMBL-EBI）・柴田裕一郎・山田英樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
(事前公開アブストラクト) 確率モデルによる生化学シミュレーションは離散的な反応系を厳密に取り扱うことができる一方，シミ... [more] | |
| RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM (共催) |
2006-01-18 14:55 |
神奈川 | 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 | データ転送網を用いた確率モデル生化学シミュレータのFPGA への実装の検討 ○吉見真聡・長名保範・岩岡 洋・西川由理・小嶋利紀（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
確率モデル生化学シミュレーションアルゴリズム(SSA)は，生化学システムの厳密なシミュレーションが可能である一方，膨大な... [more] | VLD2005-105 CPSY2005-61 RECONF2005-94 pp.47-52 |
| RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM (共催) |
2006-01-18 15:20 |
神奈川 | 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 | FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPにおける数値積分機構の性能改善手法 ○西川由理・長名保範・吉見真聡・岩岡 洋・小嶋利紀（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
近年のバイオインフォマティクスにおいて、計算機上での生化学シミュレーションは、細胞内の生化学反応を解析する非常に有効な方... [more] | VLD2005-106 CPSY2005-62 RECONF2005-95 pp.53-58 |
| RECONF, CPSY, VLD, IPSJ-SLDM (共催) |
2006-01-18 15:45 |
神奈川 | 慶應大学日吉キャンパス 来往舎 | FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPにおけるハードウェアリソース消費に関する考察 ○長名保範（慶大）・岩永直樹（長崎大）・吉見真聡・岩岡 洋・小嶋利紀・西川由理（慶大）・舟橋 啓（JST）・広井賀子（慶大）・柴田裕一郎・北野宏明（長崎大）・天野英晴（慶大） |
(事前公開アブストラクト) FPGA を用いて生化学シミュレーションを行う ReCSiP における、FPGA 上の各種リ... [more] | VLD2005-107 CPSY2005-63 RECONF2005-96 pp.59-64 |
| RECONF | 2005-09-15 16:15 |
広島 | 国民宿舎 みやじま 杜の宿 | FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiPのシミュレーション制御機構 ○長名保範・吉見真聡・岩岡 洋・小嶋利紀・西川由理（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
[more] | RECONF2005-39 pp.55-60 |
| RECONF | 2005-09-15 16:45 |
広島 | 国民宿舎 みやじま 杜の宿 | FPGAを用いた生化学シミュレータ向けSBML処理系の構築 ○岩岡 洋・長名保範・吉見真聡・小嶋利紀・西川由理（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
計算機を利用した生化学反応のシミュレーションが行なわれるようになってき た。大規模なシミュレーションモデルを扱う場合、... [more] |
RECONF2005-40 pp.61-66 |
| RECONF | 2005-05-12 14:00 |
京都 | 京都大学 | ヒープ木を用いた確率モデル生化学シミュレータのFPGAへの実装 ○吉見真聡・長名保範・岩岡 洋・福島知紀（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
[more] | RECONF2005-7 pp.37-42 |
| RECONF | 2005-05-12 14:30 |
京都 | 京都大学 | FPGAを用いた生化学シミュレータにおける反応速度関数スケジューリングに関する検討 ○岩永直樹・柴田裕一郎（長崎大）・吉見真聡・長名保範・岩岡 洋・福島知紀・天野英晴（慶大）・舟橋 啓・広井賀子・北野宏明（JST）・小栗 清（長崎大） |
常微分方程式を解く再構成可能な生化学シミュレータが、研究者が個人で利用で きる高速なシミュレーション環境として注目され... [more] |
RECONF2005-8 pp.43-48 |
| RECONF | 2005-05-12 15:00 |
京都 | 京都大学 | FPGAを用いた生化学シミュレータReCSiP向けの数値積分機構の実装と評価 ○長名保範・吉見真聡・岩岡 洋（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
[more] | RECONF2005-9 pp.49-54 |
| CPSY, VLD, IPSJ-SLDM (共催) |
2005-01-25 16:20 |
神奈川 | 慶應義塾大学 日吉キャンパス | SBML対応細胞シミュレータ環境の構築 ○岩岡 洋・長名保範・福島知紀・吉見真聡（慶大）・舟橋 啓・広井賀子（JST）・柴田裕一郎・岩永直樹（長崎大）・北野宏明（JST）・天野英晴（慶大） |
近年，細胞内の化学反応機構のシミュレーションに関する研究が盛んである．し かし，大規模なモデルを扱う場合，膨大な計算時... [more] |
VLD2004-108 CPSY2004-74 pp.63-68 |
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