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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2020-03-10 09:55 複数データを用いた遺伝子制御ネットワークの推定手法に関する検討 ○常 峰閣・島田 裕・重原孝臣（埼玉大）  NLP2019-124 |
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| 抄録 | （和） | 細胞内では，多数のタンパク質が化学反応によって遺伝子の発現を相互に促進$cdot$抑制することで複雑な情報処理$cdot$制御が行われている．この遺伝子の発現量の相互作用を表したものが遺伝子制御ネットワークである．近年，様々な手法で観測された遺伝子およびタンパク質間の相互作用に関する複数種類のデータを統合することで，遺伝子制御ネットワークを再構築する研究が注目を集めている．本報告では，Passing Attributes between Networks for Data Assimilation (PANDA)と呼ばれる遺伝子制御ネットワークの再構築手法に偏解析を導入した遺伝子制御ネットワークの再構築手法を提案する．また，数値実験により，その有効性を検証した結果を報告する． |
| （英） | Gene regulatory networks play an important role in the expression and activities of genes, where specific proteins and genes promote or suppress the expression of other genes through a chemical reaction. In this report, we focus on a method for reconstructing gene regulatory networks from multiple data sources including different types of information, such as the expression of genes and interactions between genes and proteins. We focus on the method called PANDA (Passing Attributes between Networks for Data Assimilation) and propose a method for estimating gene regulatory networks, incorporating a partial correlation technique to PANDA. Our results show that the proposed method can obtain more accurate gene regulatory networks than PANDA. | |
| キーワード | （和） | 遺伝子制御ネットワーク / 偏相関分析 / 遺伝子の発現情報 / / / / / |
| （英） | Gene regulatory networks / Partial correlation analysis / Gene expression data / / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 119, no. 471, NLP2019-124, pp. 65-70, 2020年3月. | |
| 資料番号 | NLP2019-124 | |
| 発行日 | 2020-03-02 (NLP) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | NLP2019-124 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | MSS NLP |
| 開催期間 | 2020-03-09 - 2020-03-10 |
| 開催地（和） | やすらぎの宿 蒲郡荘 |
| 開催地（英） | |
| テーマ（和） | SICE-DES研究会，IEICE-MSS研究会，IEICE-NLP研究会の3研究会併催，一般およびWork In Progress(WIP) ※(WIPセッションはDES，MSSのみ) |
| テーマ（英） | SICE-DES, IEICE-MSS, IEICE-NLP |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | NLP |
| 会議コード | 2020-03-MSS-NLP |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | 複数データを用いた遺伝子制御ネットワークの推定手法に関する検討 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | A method foe estimating gene regulatory networks based on multiple source of information about regulatory relationships |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | 遺伝子制御ネットワーク / Gene regulatory networks |
| キーワード(2)（和/英） | 偏相関分析 / Partial correlation analysis |
| キーワード(3)（和/英） | 遺伝子の発現情報 / Gene expression data |
| キーワード(4)（和/英） | / |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 常 峰閣 / Haga Cham / チャム ハガ |
| 第1著者 所属（和/英） | 埼玉大学 (略称： 埼玉大) Saitama University (略称： Saitama Univ.) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 島田 裕 / Yutaka Shimada / シマダ ユタカ |
| 第2著者 所属（和/英） | 埼玉大学 (略称： 埼玉大) Saitama University (略称： Saitama Univ.) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） | 重原 孝臣 / Takaomi Shigehara / |
| 第3著者 所属（和/英） | 埼玉大学 (略称： 埼玉大) Saitama University (略称： Saitama Univ.) |
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| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2020-03-10 09:55:00 |
| 発表時間 | 25分 |
| 申込先研究会 | NLP |
| 資料番号 | NLP2019-124 |
| 巻番号（vol） | vol.119 |
| 号番号（no） | no.471 |
| ページ範囲 | pp.65-70 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2020-03-02 (NLP) |
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