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講演抄録/キーワード
講演名 2018-03-13 14:00
NGSデータを用いた遺伝子領域内の配列変異の比較による要因遺伝子の抽出法
松井一馬工学院大)・梅津知宏大屋敷純子東京医科大)・福岡 豊工学院大MBE2017-95
抄録 (和) 次世代シーケンサ(NGS)を用いた配列変異の解析では一塩基多型を主に対象とすることが多い。特異的な変化を持つ領域の同定は可能であるが、疾患の要因遺伝子の同定は難しかった。また、一塩基多型のデータは膨大な量になり、解析時間も長くなる。従って、そのような膨大なデータを扱わず、少数で構造変異を解析する方法が求められる。この考えに基づき、本研究では構造的な変異である欠失と挿入を用い遺伝子単位で解析し、得られた遺伝子の発現量を統計的に処理することで疾患に関連する要因遺伝子を抽出する方法を提案する。 
(英) In this study, a method was proposed for determining differential mutations in next generation sequencing datasets from multiple myeloma cell lines cultured under normal and hypoxic conditions. Many differential mutations were found around tumor suppressor genes, suggesting that those genes play a role in hypoxia tolerance. The obtained gene expression data was statistically processed to extract candidate disease factor genes. These results indicated the usefulness of the proposed method.
キーワード (和) 次世代シーケンサ / 変異解析 / 要因遺伝子 / / / / /  
(英) Next Generation Sequencer / mutation analysis / factor gene / / / / /  
文献情報 信学技報, vol. 117, no. 507, MBE2017-95, pp. 79-82, 2018年3月.
資料番号 MBE2017-95 
発行日 2018-03-06 (MBE) 
ISSN Print edition: ISSN 0913-5685  Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
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PDFダウンロード MBE2017-95

研究会情報
研究会 MBE NC  
開催期間 2018-03-13 - 2018-03-14 
開催地(和) 機械振興会館 
開催地(英) Kikai-Shinko-Kaikan Bldg. 
テーマ(和) ME,一般 
テーマ(英) ME, general 
講演論文情報の詳細
申込み研究会 MBE 
会議コード 2018-03-MBE-NC 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) NGSデータを用いた遺伝子領域内の配列変異の比較による要因遺伝子の抽出法 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Extraction of Factor Genes by Comparing Sequence Mutations in Gene Regions Based on NGS Data 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) 次世代シーケンサ / Next Generation Sequencer  
キーワード(2)(和/英) 変異解析 / mutation analysis  
キーワード(3)(和/英) 要因遺伝子 / factor gene  
キーワード(4)(和/英) /  
キーワード(5)(和/英) /  
キーワード(6)(和/英) /  
キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 松井 一馬 / Kazuma Matsui / マツイ カズマ
第1著者 所属(和/英) 工学院大学 (略称: 工学院大)
Kogakuin University (略称: Kogakuin Univ.)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 梅津 知宏 / Tomohiro Umezu / ウメヅ トモヒロ
第2著者 所属(和/英) 東京医科大学 (略称: 東京医科大)
Tokyo Medical University (略称: Tokyo Medical Univ.)
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) 大屋敷 純子 / Junko H. Ohyashiki / オオヤシキ ジュンコ
第3著者 所属(和/英) 東京医科大学 (略称: 東京医科大)
Tokyo Medical University (略称: Tokyo Medical Univ.)
第4著者 氏名(和/英/ヨミ) 福岡 豊 / Yutaka Fukuoka / フクオカ ユタカ
第4著者 所属(和/英) 工学院大学 (略称: 工学院大)
Kogakuin University (略称: Kogakuin Univ.)
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講演者
発表日時 2018-03-13 14:00:00 
発表時間 25 
申込先研究会 MBE 
資料番号 IEICE-MBE2017-95 
巻番号(vol) IEICE-117 
号番号(no) no.507 
ページ範囲 pp.79-82 
ページ数 IEICE-4 
発行日 IEICE-MBE-2018-03-06 


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