講演抄録/キーワード |
講演名 |
2018-03-13 14:00
NGSデータを用いた遺伝子領域内の配列変異の比較による要因遺伝子の抽出法 ○松井一馬(工学院大)・梅津知宏・大屋敷純子(東京医科大)・福岡 豊(工学院大) MBE2017-95 |
抄録 |
(和) |
次世代シーケンサ(NGS)を用いた配列変異の解析では一塩基多型を主に対象とすることが多い。特異的な変化を持つ領域の同定は可能であるが、疾患の要因遺伝子の同定は難しかった。また、一塩基多型のデータは膨大な量になり、解析時間も長くなる。従って、そのような膨大なデータを扱わず、少数で構造変異を解析する方法が求められる。この考えに基づき、本研究では構造的な変異である欠失と挿入を用い遺伝子単位で解析し、得られた遺伝子の発現量を統計的に処理することで疾患に関連する要因遺伝子を抽出する方法を提案する。 |
(英) |
In this study, a method was proposed for determining differential mutations in next generation sequencing datasets from multiple myeloma cell lines cultured under normal and hypoxic conditions. Many differential mutations were found around tumor suppressor genes, suggesting that those genes play a role in hypoxia tolerance. The obtained gene expression data was statistically processed to extract candidate disease factor genes. These results indicated the usefulness of the proposed method. |
キーワード |
(和) |
次世代シーケンサ / 変異解析 / 要因遺伝子 / / / / / |
(英) |
Next Generation Sequencer / mutation analysis / factor gene / / / / / |
文献情報 |
信学技報, vol. 117, no. 507, MBE2017-95, pp. 79-82, 2018年3月. |
資料番号 |
MBE2017-95 |
発行日 |
2018-03-06 (MBE) |
ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
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MBE2017-95 |