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| 講演抄録／キーワード | ||
| 講演名 | 2015-06-05 13:55 Dockerコンテナおよびクラウドシステムの次世代シーケンサー解析への活用 ○小笠原 理（国立遺伝学研）・大田達郎（DBCLS）  SC2015-3 |
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| 抄録 | （和） | 科学研究において研究報告の結果の再現性確保は最も基本的な要件であるが、近年の測定技術の進歩とそれに伴うデータの大規模化や解析の高度化により大規模データ解析の再現は一般に容易ではなくなってきている。この問題は次世代シーケンサーのデータ解析の分野においても顕在化してきているが、本研究では遺伝研スパコンの運用の見地からデータサイズの急増による生物・医学系研究者からの計算資源に対する要求の増大に対応するためにDockerコンテナやクラウドシステムの活用の方法と今後の展望について述べる。 |
| （英） | Reproducibility of the results of research papers is one of the most fundamental requirement for scientific researches. However, with the recent advent of measurement technology and accompanying data deluge and sophistication of data analysis methods, the reproduction of large scale data analysis is becoming more difficult in general. This problem has being actualized in the field of next generation sequencer (NGS) data analysis. In this report, we would like to discuss the applications of Docker containers and cloud systems and their future extensions to cope with the increase of researcher’s demands for computer resources, from the viewpoint of service operation of the NIG supercomputer system. | |
| キーワード | （和） | DNA / バイオインフォマティックス / Docker / クラウド / / / / |
| （英） | DNA / bioinformatics / Docker / cloud / / / / | |
| 文献情報 | 信学技報, vol. 115, no. 72, SC2015-3, pp. 13-18, 2015年6月. | |
| 資料番号 | SC2015-3 | |
| 発行日 | 2015-05-29 (SC) | |
| ISSN | Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 | |
| 著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します．(許諾番号：10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) | |
| PDFダウンロード | SC2015-3 |
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| 研究会情報 | |
| 研究会 | SC |
| 開催期間 | 2015-06-05 - 2015-06-05 |
| 開催地（和） | 国立情報学研究所(NII) 12F会議室（1210/1208） |
| 開催地（英） | National Institute of Informatics 12F 1210/1208 |
| テーマ（和） | 「Webサービスおよびクラウドの構築・運用・管理」および一般 |
| テーマ（英） | Web Services, Cloud Computing, Services |
| 講演論文情報の詳細 | |
| 申込み研究会 | SC |
| 会議コード | 2015-06-SC |
| 本文の言語 | 日本語 |
| タイトル（和） | Dockerコンテナおよびクラウドシステムの次世代シーケンサー解析への活用 |
| サブタイトル（和） | |
| タイトル（英） | Applications of Docker Containers and Cloud Systems to Next Generation Sequencing Data Analysis |
| サブタイトル（英） | |
| キーワード(1)（和/英） | DNA / DNA |
| キーワード(2)（和/英） | バイオインフォマティックス / bioinformatics |
| キーワード(3)（和/英） | Docker / Docker |
| キーワード(4)（和/英） | クラウド / cloud |
| キーワード(5)（和/英） | / |
| キーワード(6)（和/英） | / |
| キーワード(7)（和/英） | / |
| キーワード(8)（和/英） | / |
| 第1著者 氏名（和/英/ヨミ） | 小笠原 理 / Osamu Ogasawara / オガサワラ オサム |
| 第1著者 所属（和/英） | 国立遺伝学研究所 (略称： 国立遺伝学研) National Institute of Genetics (略称： Nat. Inst. Genet.) |
| 第2著者 氏名（和/英/ヨミ） | 大田 達郎 / Tazro Ohta / オオタ タツロウ |
| 第2著者 所属（和/英） | ライフサイエンス統合データベースセンター (略称： DBCLS) Database Center for Life Science (略称： DBCLS) |
| 第3著者 氏名（和/英/ヨミ） | / / |
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| 講演者 | 第1著者 |
| 発表日時 | 2015-06-05 13:55:00 |
| 発表時間 | 25分 |
| 申込先研究会 | SC |
| 資料番号 | SC2015-3 |
| 巻番号（vol） | vol.115 |
| 号番号（no） | no.72 |
| ページ範囲 | pp.13-18 |
| ページ数 | 6 |
| 発行日 | 2015-05-29 (SC) |
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