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講演抄録/キーワード
講演名 2014-10-07 13:40
遺伝研スーパーコンピュータおよび国際塩基配列データベース(INSD)のネットワーク環境
小笠原 理国立遺伝学研IA2014-26
抄録 (和) 遺伝研スーパーコンピュータは(1)DDBJ(日)EMBL-Bank(英),Genbank(米)の協力で作られてい
る国際塩基配列データベース(INSD)の構築(2)DNA 配列の検索解析サービスの提供(3)計算資源そのものの提供を目
的として運営されている。次世代シーケンサー(NGS)の進歩により我々DDBJ センターおよび生命系の研究者は千倍
以上のデータ量の増加に直面しており、ストレージ、計算能力、ネットワーク帯域に対する要求が急速に高まって
いる。本報告ではINSD 構築および遺伝研スパコンの現状とそれを支えるネットワーク環境の現在および将来の見
通しについて述べる。 
(英) The supercomputer system of the National Institute of Genetics (NIG) has as its purpose (1) construction of the
International DNA Sequence Database (INSD), a tripartite collaboration between DNA Data Bank of Japan (DDBJ),
EMBL-Bank in the UK, and Genbank in the US; (2) providing search and analysis services for the DNA sequence data; and
(3) providing computational resources to researchers. With the recent advent of next-generation sequencers (NGS), biological
researchers have been confronted with a more than1,000-fold data deluge, which has led to a rapid increase in demands for
storage, calculation capacity, and network bandwidth. In this report, the current state of INSD construction, the NIG
supercomputer, and the future direction of the network environment that supports the projects are discussed.
キーワード (和) DNA / バイオインフォマティックス / データベース / スーパーコンピューター / / / /  
(英) DNA / Bioinformatics / Database / Supercomputer / / / /  
文献情報 信学技報, vol. 114, no. 236, IA2014-26, pp. 13-18, 2014年10月.
資料番号 IA2014-26 
発行日 2014-09-30 (IA) 
ISSN Print edition: ISSN 0913-5685  Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034)
PDFダウンロード IA2014-26

研究会情報
研究会 IA  
開催期間 2014-10-07 - 2014-10-07 
開催地(和) グランフロント大阪 タワーB 10F 
開催地(英) Grand Front OSAKA Tower-B 10F 
テーマ(和) ネットワーク研究開発テストベッド運用・利用,一般 (ADVNET共催) 
テーマ(英) Network R&D Testbed Operation and Utilization, etc. (cosponsored by ADVNET) 
講演論文情報の詳細
申込み研究会 IA 
会議コード 2014-10-IA 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) 遺伝研スーパーコンピュータおよび国際塩基配列データベース(INSD)のネットワーク環境 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Network environments of the NIG supercomputer and International Nucleotide Sequence Database (INSD) 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) DNA / DNA  
キーワード(2)(和/英) バイオインフォマティックス / Bioinformatics  
キーワード(3)(和/英) データベース / Database  
キーワード(4)(和/英) スーパーコンピューター / Supercomputer  
キーワード(5)(和/英) /  
キーワード(6)(和/英) /  
キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 小笠原 理 / Osamu Ogasawara / オガサワラ オサム
第1著者 所属(和/英) 国立遺伝学研究所 (略称: 国立遺伝学研)
National Institute of Genetics (略称: NIG)
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講演者
発表日時 2014-10-07 13:40:00 
発表時間 25 
申込先研究会 IA 
資料番号 IEICE-IA2014-26 
巻番号(vol) IEICE-114 
号番号(no) no.236 
ページ範囲 pp.13-18 
ページ数 IEICE-6 
発行日 IEICE-IA-2014-09-30 


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