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講演抄録/キーワード
講演名 2009-08-07 09:30
シグナル伝達経路のペトリネット表現に基づく反応パラメータ条件式導出アルゴリズムの提案
三輪良雅山口大)・樋岡幹司バブ日立ソフト)・葛 崎偉松野浩嗣山口大CST2009-16
抄録 (和) 本稿では,ある与えられたシグナル伝達経路のペトリネットモデルについて,その構造情報のみからシグナルフローに必要な反応パラメータを推定する条件式の導出方法を提案する.提案手法の有効性の確認は,IL-1 シグナル伝達経路の一部をペトリットモデル化し,条件式を適用して反応パラメータの一つである遅延時間を求め,Cell
Illustrator3.0 によってシミュレーションを実行することによって行った. 
(英) In this paper, we propose an algorithm to produce conditional equations for smooth signal flows in the Petri net model of a signaling pathway. Firstly, we have modeled a discrete Petri net model of IL-1 signaling pathway. Then, we have determined the firing frequency of each transition by appling the proposed method for a part of the Petri net model of IL-1 signaling pathway. Finally, we have simulated Petri net model of IL-1 signaling pathway to confirme the appropriateness and validity of proposed method by using Cell Illustrator3.0 with the decided delay times.
キーワード (和) ペトリネット / シグナル伝達経路 / モデル化 / アルゴリズム / シミュレーション / / /  
(英) Petri nets / Signaling pathways / Modeling / Algorithm / Simulation / / /  
文献情報 信学技報, vol. 109, 2009年8月.
資料番号  
発行日 2009-07-30 (CST) 
ISSN Print edition: ISSN 0913-5685    Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034)
PDFダウンロード CST2009-16

研究会情報
研究会 MSS  
開催期間 2009-08-06 - 2009-08-07 
開催地(和) JAIST東京キャンパス 
開催地(英) JAIST Tokyo Campus 
テーマ(和) システムバイオロジー,一般 
テーマ(英) Systems Biology, etc 
講演論文情報の詳細
申込み研究会 MSS 
会議コード 2009-08-CST 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) シグナル伝達経路のペトリネット表現に基づく反応パラメータ条件式導出アルゴリズムの提案 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) An Algorithm to Produce Conditional Equations for Smooth Signal Flows in the Petri Net Model of a Signaling Pathway 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) ペトリネット / Petri nets  
キーワード(2)(和/英) シグナル伝達経路 / Signaling pathways  
キーワード(3)(和/英) モデル化 / Modeling  
キーワード(4)(和/英) アルゴリズム / Algorithm  
キーワード(5)(和/英) シミュレーション / Simulation  
キーワード(6)(和/英) /  
キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 三輪 良雅 / Yoshimasa Miwa / ミワ ヨシマサ
第1著者 所属(和/英) 山口大学 (略称: 山口大)
Yamaguchi University (略称: Yamaguchi Univ.)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 樋岡 幹司 / Kanji Hioka / ヒオカ カンジ
第2著者 所属(和/英) バブ日立ソフト株式会社 (略称: バブ日立ソフト)
Bab-Hitachi Softare K.K. (略称: Bab-Hitachi Soft.)
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) 葛 崎偉 / Qi-Wei Ge / カツ キイ
第3著者 所属(和/英) 山口大学 (略称: 山口大)
Yamaguchi University (略称: Yamaguchi Univ.)
第4著者 氏名(和/英/ヨミ) 松野 浩嗣 / Hiroshi Matsuno / マツノ ヒロシ
第4著者 所属(和/英) 山口大学 (略称: 山口大)
Yamaguchi University (略称: Yamaguchi Univ.)
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講演者 第1著者 
発表日時 2009-08-07 09:30:00 
発表時間 50分 
申込先研究会 MSS 
資料番号 CST2009-16 
巻番号(vol) vol.109 
号番号(no) no.165 
ページ範囲 pp.25-30 
ページ数
発行日 2009-07-30 (CST) 


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