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講演抄録/キーワード
講演名 2007-11-22 11:30
ブーリアンネットワークにおけるモチーフ構造の埋め込みの効果
大澤智興九工大)・竹本和広京大NLP2007-95
抄録 (和) 3ノードからなるネットワークモチーフ構造の機能を調べるため、6種の異なるモチーフ構造を転写制御ネットワークのモデルであるブーリアンネットワークに埋め込み、力学的性質を比較した。全てのモチーフ構造について、埋め込み数が増大すると、ノード間の平均距離が増大し、さらに相互情報量も増大した。モチーフ内のエッジ数が増大すると、それらの傾向は、より顕著に現れた。モチーフ構造の一種であるフィードフォワードループは、他の5種とは異なり、埋め込み数が増大すると、アトラクタ数は減少し、さらに、エントロピーも減少した。これは、フィードフォワードループは、状態空間の自由度を減少させ、時間的な秩序を生成やすい構造であることを示している。この結果は、生体内の複雑ネットワーク中で、フィードフォワードループが、他のモチーフ構造より比較的多く見いだされることに関係している可能性があるかもしれない。 
(英) We show advantages of feedforward loops using Boolean network that is one of the discrete dynamical models for the transcriptional regulatory networks. After making comparison dynamical behaviors from the networks embedded six different motif structures including feedback and feedforward loops, we found that feedforward loops can provide higher temporal order(coherence) with lower entropy(randomness) in temporal program of gene expression. The other five motif structures show opposite effect on dynamics of the networks. These results may as well suggest that feedforward loop is one of the favorable local structures in biological complex networks.
キーワード (和) ネットワークモチーフ / ブーリアンネットワーク / エントロピー / 相互情報量 / / / /  
(英) network motif / Boolean network / entropy / mutual information / / / /  
文献情報 信学技報, vol. 107, no. 349, NLP2007-95, pp. 1-6, 2007年11月.
資料番号 NLP2007-95 
発行日 2007-11-15 (NLP) 
ISSN Print edition: ISSN 0913-5685    Online edition: ISSN 2432-6380
著作権に
ついて
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034)
PDFダウンロード NLP2007-95

研究会情報
研究会 NLP  
開催期間 2007-11-22 - 2007-11-22 
開催地(和) 九州大学 
開催地(英)  
テーマ(和) 一般 
テーマ(英)  
講演論文情報の詳細
申込み研究会 NLP 
会議コード 2007-11-NLP 
本文の言語 日本語 
タイトル(和) ブーリアンネットワークにおけるモチーフ構造の埋め込みの効果 
サブタイトル(和)  
タイトル(英) Effects of embedded motifs on behavior of Boolean networks 
サブタイトル(英)  
キーワード(1)(和/英) ネットワークモチーフ / network motif  
キーワード(2)(和/英) ブーリアンネットワーク / Boolean network  
キーワード(3)(和/英) エントロピー / entropy  
キーワード(4)(和/英) 相互情報量 / mutual information  
キーワード(5)(和/英) /  
キーワード(6)(和/英) /  
キーワード(7)(和/英) /  
キーワード(8)(和/英) /  
第1著者 氏名(和/英/ヨミ) 大澤 智興 / Chikoo Oosawa / オオサワ チコオ
第1著者 所属(和/英) 九州工業大学 (略称: 九工大)
Kyushu Institute of Technology (略称: KIT)
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) 竹本 和広 / Kazuhiro Takemoto /
第2著者 所属(和/英) 京都大学 (略称: 京大)
Kyoto University (略称: Kyoto Univ.)
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講演者 第1著者 
発表日時 2007-11-22 11:30:00 
発表時間 25分 
申込先研究会 NLP 
資料番号 NLP2007-95 
巻番号(vol) vol.107 
号番号(no) no.349 
ページ範囲 pp.1-6 
ページ数
発行日 2007-11-15 (NLP) 


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