講演抄録/キーワード |
講演名 |
2007-11-22 11:30
ブーリアンネットワークにおけるモチーフ構造の埋め込みの効果 ○大澤智興(九工大)・竹本和広(京大) NLP2007-95 |
抄録 |
(和) |
3ノードからなるネットワークモチーフ構造の機能を調べるため、6種の異なるモチーフ構造を転写制御ネットワークのモデルであるブーリアンネットワークに埋め込み、力学的性質を比較した。全てのモチーフ構造について、埋め込み数が増大すると、ノード間の平均距離が増大し、さらに相互情報量も増大した。モチーフ内のエッジ数が増大すると、それらの傾向は、より顕著に現れた。モチーフ構造の一種であるフィードフォワードループは、他の5種とは異なり、埋め込み数が増大すると、アトラクタ数は減少し、さらに、エントロピーも減少した。これは、フィードフォワードループは、状態空間の自由度を減少させ、時間的な秩序を生成やすい構造であることを示している。この結果は、生体内の複雑ネットワーク中で、フィードフォワードループが、他のモチーフ構造より比較的多く見いだされることに関係している可能性があるかもしれない。 |
(英) |
We show advantages of feedforward loops using Boolean network that is one of the discrete dynamical models for the transcriptional regulatory networks. After making comparison dynamical behaviors from the networks embedded six different motif structures including feedback and feedforward loops, we found that feedforward loops can provide higher temporal order(coherence) with lower entropy(randomness) in temporal program of gene expression. The other five motif structures show opposite effect on dynamics of the networks. These results may as well suggest that feedforward loop is one of the favorable local structures in biological complex networks. |
キーワード |
(和) |
ネットワークモチーフ / ブーリアンネットワーク / エントロピー / 相互情報量 / / / / |
(英) |
network motif / Boolean network / entropy / mutual information / / / / |
文献情報 |
信学技報, vol. 107, no. 349, NLP2007-95, pp. 1-6, 2007年11月. |
資料番号 |
NLP2007-95 |
発行日 |
2007-11-15 (NLP) |
ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
PDFダウンロード |
NLP2007-95 |