講演抄録/キーワード |
講演名 |
2006-03-15 10:10
Bidomain modelにおける大規模連立一次方程式の高速解法開発の試み ○鈴木 亨(岡山大)・佐藤俊輔(藍野大)・大江 透(岡山大)・鈴木良次(金沢工大)・梶谷文彦(岡山大) |
抄録 |
(和) |
3次元バイドメインモデルにおける大規模連立一次方程式を高速に解く解法を考察した。有限体積法により10×5×5mmの直方体形状の仮想心筋組織を構成し,対角にcathode及びanode電極を配置し,1mAの電流を流し続けた。細胞外電位の連立一次方程式の求解に,3-grid, V-cycle型のマルチグリッド法を使用した。最も粗いグリッドではLU分解,その上の細かいグリッドでは不完全LU分解(ILU)またはGauss-Seidel法を反復使用した。さらに,過去数ステップ分の初期残差を利用したGCR法により現在の初期残差を短縮する方法も併用した。その結果,スムーザーにILU1を使用した場合に最も速く,モノドメインモデルの3倍程度の時間で計算できた。 |
(英) |
To solve the large linear system of a 3-dimensional bidomain model (BM) as fast as possible, we evaluated the multi-grid (MG) method with various smoothers. We constructed a 10x5x5mm rectangular-shaped cardiac tissue model with 1mA constant current stimuli through the electrodes at the corners of the tissue. We adopted the 3-grid, V-cycle MG, used LU decomposition as a complete solver at the coarsest grid, and used Gauss-Seidel or ILU-preconditioned Jacobi as a smoother. Furthermore, we developed an accelerator utilizing GCR with previously calculated residuals. As a result, we found ILU1 was the fastest smoother and we could calculate BM with only 3 times as much time as for the monodomain model. |
キーワード |
(和) |
心臓電気生理 / バイドメインモデル / 境界値問題 / 大規模連立一次方程式 / マルチグリッド / / / |
(英) |
cardiac electrophysiology / bidomain model / boundary value problem / large linear system / multi-grid / / / |
文献情報 |
信学技報, vol. 105, no. 655, MBE2005-129, pp. 5-8, 2006年3月. |
資料番号 |
MBE2005-129 |
発行日 |
2006-03-08 (MBE) |
ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 |
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